R语言 GSEABase包 getOBOCollection()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getOBOCollection(GSEABase)
getOBOCollection()所属R语言包：GSEABase

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                                         阅读OBO的指定的基因本体论集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

getOBOCollection parses a uri (file or internet location) encoded following the OBO specification defined by the Gene Onotology consortium.
getOBOCollection解析URI（文件或Internet位置）继奥博由的基因Onotology财团的规范定义编码。


用法----------Usage----------


getOBOCollection(uri, evidenceCode="ANY", ...)



参数----------Arguments----------

参数：uri
A file name or URL containing gene sets encoded following the OBO specification.
文件名或URL含有基因组编码后奥博规范。


参数：evidenceCode
A character vector of evidence codes.
证据代码的一个特征向量。


参数：...
Further arguments passed to the OBOCollection constructor.
进一步的参数传递给OBOCollection构造。


值----------Value----------

getOBOCollection returns an OBOCollection of gene sets. The gene set is constructed by parsing the file for id tags in TERM stanzas. The parser does not currently support all features of OBO, e.g., the ability to import additional files.
getOBOCollection返回一个基因组OBOCollection。基因组构造由id节TERM标签在解析文件。解析器目前不支持OBO的，例如，能够导入其他文件的所有功能。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan <mtmrogan@fhcrc.org>



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

OBOCollection, OBOCollection
OBOCollection，OBOCollection


举例----------Examples----------


## 'fl' could also be a URI[＃FL也可以是一个URI]
fl <- system.file("extdata", "goslim_plant.obo", package="GSEABase")
getOBOCollection(fl) # GeneSetCollection of 2 sets[GeneSetCollection的2套]

## Not run: [＃无法运行：]
## Download from the internet[＃从网上下载]
fl <- "http://www.geneontology.org/GO_slims/goslim_plant.obo"
getOBOCollection(fl, evidenceCode="TAS")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。