apoptosisGraph(graph)
apoptosisGraph()所属R语言包：graph
KEGG apoptosis pathway graph
KEGG凋亡通路图
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A graph representing the apoptosis pathway from KEGG, as well as a data.frame of attributes for use in plotting the graph with Rgraphviz and a list to compare the nodes with their respective LocusLink IDs.
一个代表从KEGG凋亡通路，以及数据框的属性，使用中策划Rgraphviz和一个列表比较各自的LocusLink标识的节点的图图。
用法----------Usage----------
data(apopGraph)
Details
详情----------Details----------
The apopGraph data set contains three objects:
apopGraph数据集包含三个对象：
The first is apopGraph, which is an object of class graph-NEL and represents the hsa04210 graph from KEGG.
首先是：apopGraph类graph-NEL这是一个对象，并表示从KEGGhsa04210图。
The second is apopAttrs, which is a data.frame with two columns, and a row for every node in apopGraph. The first column lists what color the node is represented with on the KEGG site. The second column lists the type of the node - either genesym or text. Most nodes are of type genesym as they represent genes, but some of the nodes in the KEGG graph were not genes and thus those nodes are of type text.
第二个是apopAttrs，这是一个具有两列的数据框，并为每个节点apopGraph行。第一列列出什么颜色的节点代表KEGG网站上。第二列列出了节点类型 - 无论是genesym或text。大多数节点类型genesym，因为他们所代表的基因，但一些KEGG图中的节点是不是基因，因此这些节点类型text。
The third, apopLocusLink is a named list where the names correspond to the node names in apopGraph. The values of the list are the LocusLink IDs that correspond to that node in the KEGG graph.
第三，apopLocusLink是一个名为名称对应apopGraph节点名称的列表。列表中的值的的LocusLink标识相对应的节点在KEGG图的。
源----------Source----------
http://www.genome.ad.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04210.html
举例----------Examples----------
data(apopGraph)
if (require("Rgraphviz") & interactive())
plot(apopGraph)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-25 21:04:51
