R语言 GraphAlignment包 EncodeDirectedGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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EncodeDirectedGraph(GraphAlignment)
EncodeDirectedGraph()所属R语言包：GraphAlignment

                                        Encode directed graph
                                         编码有向图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Encode an adjacency matrix for a directed graph into a symmetric matrix.
编码成一个对称矩阵的有向图的邻接矩阵。


用法----------Usage----------


EncodeDirectedGraph(matrix, P)



参数----------Arguments----------

参数：matrix
square matrix
方阵


参数：P
permutation vector
置换向量


Details

详情----------Details----------

This function encodes an adjacency matrix for a directed graph into a symmetric matrix. Currently only binary directed graphs are implemented. The adjacency matrix of a binary directed graph has elements 0, 1. The same graph can be represented by a symmetric adjacency matrix with elements -1, 0, 1, with the sign of the entry indicating the direction of the link. The result is obtained by setting entries (i, j) and (j, i) of the target matrix m' to 1 if entry m[i, j] = 1 and P[i] > P[j] and to -1 if m[i, j] = 1 and P[j] > P[i].
此功能编码成一个对称矩阵的有向图的邻接矩阵。目前只有二进制的指示图的实施。二进制向图的邻接矩阵元素0，1。相同的图形，可以对称邻接矩阵的一个元素-1，0，1，指示方向的链接进入的标志，代表。结果获得通过设置项（I，J）和矩阵m 1（J，I）的目标，如果进入M [我] = 1和P [I]>磷[J]， - 1，如果M [I，J] = 1和P [J]>磷[我]。


值----------Value----------

The return value is a symmetric matrix representing the encoded input matrix.
返回值是一个对称矩阵，编码输入矩阵。


作者（S）----------Author(s)----------


Joern P. Meier, Michal Kolar, Ville Mustonen, Michael Laessig, and Johannes Berg



举例----------Examples----------


  dg <- matrix(c(0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1), 3, 3)
  EncodeDirectedGraph(dg, 1:dim(dg)[1])

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