R语言 GOstats包 hyperGTest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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hyperGTest(GOstats)
hyperGTest()所属R语言包：GOstats

                                        Hypergeometric Tests for GO term association
                                         好长远协会超几何试验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a GOHyperGParams instance containing a set of unique Entrez Gene Identifiers, a microarray annotation data package name, and the GO ontology of interest, this function will compute Hypergeomtric p-values for over or under-representation of each GO term in the specified ontology among the GO annotations for the interesting genes.  The computations can
鉴于GOHyperGParams实例，其中包含了一套独特的Entrez基因标识，一个芯片的注释数据包名称，和权益的本体，此函数将计算或每个GO术语代表Hypergeomtric p值有趣的基因的GO注释中指定的本体。计算


参数----------Arguments----------

参数：p
A GOHyperGParams instance  
一个GOHyperGParams实例


Details

详情----------Details----------

When conditional(p) == TRUE, the hyperGTest function uses the structure of the GO graph to estimate for each term whether or not there is evidence beyond that which is provided by the term's children to call the term in question statistically overrepresented.
当conditional(p) == TRUE，hyperGTest函数使用的好图，估计每学期是否有证据以外，这是由术语的儿童提供呼叫统计人数过多的问题术语的结构。

The algorithm conditions on all child terms that are themselves significant at the specified p-value cutoff.  Given a subgraph of one of the three GO ontologies, the terms with no child categories are tested first.  Next the nodes whose children have already been tested are tested.  If any of a given node's children tested significant, the appropriate conditioning is performed.
所有的孩子而言，本身是在指定的p值截止显着的算法条件。鉴于三个基因本体中的一个子，没有子类的条款是第一次测试。未来的节点，其已经测试，测试的儿童。如果任何一个给定节点的儿童测试显着，进行适当的调理。


值----------Value----------

A GOHyperGResult instance.
一个GOHyperGResult实例。


作者（S）----------Author(s)----------


Seth Falcon



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>GOHyperGResult-class</code>,  <code>geneGoHyperGeoTest</code>, <code>geneKeggHyperGeoTest</code>
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注：
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