R语言 GOstats包 compCorrGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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compCorrGraph(GOstats)
compCorrGraph()所属R语言包：GOstats

                                        A function to compute a correlation based graph from Gene
                                         一个函数来计算从基因相关基础图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a set of gene expression data (an instance of the ExpressionSet class) this function computes a graph based on correlations between the probes.
鉴于一组基因表达数据的（ExpressionSet类的一个实例）此函数计算基于探针之间的相关性图表。


用法----------Usage----------


compCorrGraph(eSet, k = 1, tau = 0.6)



参数----------Arguments----------

参数：eSet
An instance of the ExpressionSet class.  
ExpressionSet类的一个实例。


参数：k
The power to raise the correlations to.  
权力，以提高相关。


参数：tau
The lower cutoff for absolute correlations.  
截止为绝对的相关性较低。


Details

详情----------Details----------

Zhou et al. describe a method of computing a graph between probes (genes) based on estimated correlations between probes. This function implements some of their methods.
周等。描述了一个基于探针之间的估计相关的探针（基因）之间的图形计算方法。此功能实现了他们的一些方法。

Pearson correlations between probes are computed and then these are raised to the power k. Any of the resulting estimates that are less than tau in absolute value are set to zero.
探针之间的皮尔逊相关系数计算，那么这些提高电源k。任何tau绝对值比所产生的估计都设置为零。


值----------Value----------

An instance of the graph class. With edges and edge weights determined by applying the algorithm described previously.
graph类的一个实例。与应用的边缘和确定边权重算法描述。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

compGdist
compGdist


举例----------Examples----------



## Create an ExpressionSet to work with[＃创建一个ExpressionSet工作]
set.seed(123)
exprMat <- matrix(runif(50 * 5), nrow=50)
genData <- new("ExpressionSet", exprs=exprMat)

corrG = compCorrGraph(genData)


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