R语言 goseq包 genes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

genes(goseq)
genes()所属R语言包：goseq

                                        Androgen stimulation of prostate cancer Cell lines.
                                         雄激素刺激前列腺癌单元株。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set gives the RNA-seq data from an experiment measuring the effects of androgen stimulation on prostate cancer.   Information is given about all (ENSEMBL) genes for which there was at least one mapping read in either the treated or untreated RNA-seq experiment. The edgeR package was used to determine which genes were differentially expressed.  The details of the analysis can be found in the goseq vignette.
这组数据给出了RNA-seq的数据，从实验测量前列腺癌雄激素刺激的影响。定约（ENSEMBL）的基因，其中有至少一个映射的处理或未经处理的RNA-seq的实验中读取信息。 edgeR包被用来确定哪些基因差异表达。分析的细节，可以发现在goseq小插曲。


用法----------Usage----------


data(genes)



格式----------Format----------

A named vector of ENSEMBL genes, with 1 representing differential expression.
命名的ENSEMBL基因的向量，用1代表差异表达。


源----------Source----------

Determination of tag density required for digital transcriptome analysis: application to an androgen-sensitive prostate cancer model, 2008, Li et. al.
数字转录分析所需的标记密度的测定：应用雄激素敏感的前列腺癌模型，2008年，李等。等。


参考文献----------References----------

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Date: Dec 23 Vol: 105 Issue: 51 Pages: 20179-84

举例----------Examples----------


data(genes)
head(genes)

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