R语言 goProfiles包 printProfiles()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

printProfiles(goProfiles)
printProfiles()所属R语言包：goProfiles

                                        Print functional profiles
                                         打印功能的配置文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Prints basic functional profiles created with the 'basicProfile' instruction. Allows for several formatting operations such as truncating long labels,  removing empty categories or choosing between absolute or relative frequencies. If several profiles have to be printed together they must be first merged using the 'mergeProfiles' function.
打印与创建“basicProfile”指令的基本功能概况。允许截断长标签，删除空的类别或绝对或相对频率之间进行选择，如一些格式化操作。如果有多个配置文件必须印在一起，他们必须先合并使用“mergeProfiles”的功能。


用法----------Usage----------


printProfiles(aProf, aTitle = "Functional Profile", anOnto = NULL, percentage = FALSE,
      Width=25, emptyCats=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：aProf
Functional profile to plot
绘制功能简介


参数：aTitle
Title for the figures
标题为“数字


参数：anOnto
Ontology (to appear in the title)
本体（出现在标题）


参数：percentage
Plot absolute or relative frequencies (not summing to 100)
图绝对或相对频率（不总结100）


参数：Width
Maximum width for the description of GO categories
最大宽度为GO类别的说明


参数：emptyCats
Set to 'TRUE' if empty categories should appear in the profile
设置为“TRUE”，如果是空的类别应该出现在配置文件中


值----------Value----------

The printout
打印输出


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Sanchez



举例----------Examples----------


require(goProfiles)
data(prostateIds)
welsh.MF <- basicProfile (welsh01EntrezIDs[1:100], onto="MF", level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
singh.MF <- basicProfile (singh01EntrezIDs[1:100], onto="MF", level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
printProfiles(welsh.MF,'Functional profiles for Welsh dataset',percentage=TRUE, anOnto='MF')
welsh.singh.MF <-mergeProfilesLists(welsh.MF, singh.MF, profNames=c("Welsh", "Singh"))
printProfiles(welsh.singh.MF, percentage=TRUE, emptyCats=TRUE)

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