R语言 goProfiles包 compSummary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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compSummary(goProfiles)
compSummary()所属R语言包：goProfiles

                                        This function returns a brief summary of the comparison between two (expanded) profiles.
                                         这个函数返回一个简要两个（扩大）型材之间的比较。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to return a brief summary of the comparison between two (expanded) profiles.
函数返回一个简要的两个（扩大）型材之间的比较。


用法----------Usage----------


compSummary(l, decs = 6)



参数----------Arguments----------

参数：l
A list of comparison results as returned by a call to compareGenelists
比较结果列表，通过调用返回compareGenelists


参数：decs
Number of decimal places to use in the output
在输出中使用的小数位数


值----------Value----------

A data frame with the summarized results of each comparison. The values contained are: Sqr.Eucl.Dist: The squared euclidean distance,  Standard Err: The standard error estimate, pValue p value of the test,  low conf.intLower value for the desired confidence interval,  up conf.intUpper value for the desired condfidence interval.
与每个比较结果汇总的数据框。中包含的值是：Sqr.Eucl.Dist：欧氏距离平方，Standard Err：标准的错误估计，pValuep的测试值，low conf.int较低的值所需的置信区间，up conf.int上价值为所需的condfidence间隔。


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Sanchez



举例----------Examples----------


data(prostateIds)
expandedWelsh <- expandedProfile(welsh01EntrezIDs[1:100], onto="MF",
                        level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
expandedSingh <- expandedProfile(singh01EntrezIDs[1:100], onto="MF",
                        level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
commonGenes <- intersect(welsh01EntrezIDs[1:100], singh01EntrezIDs[1:100])
commonExpanded <- expandedProfile(commonGenes, onto="MF", level=2, orgPackage="org.Hs.eg.db")
comparedMF <-compareGOProfiles (pn=expandedWelsh,
                          qm  = expandedSingh,
                          pqn0= commonExpanded)
print(comparedMF)
# print(compSummary(comparedMF))[打印（compSummary（comparedMF））]


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