R语言 GOFunction包 enrichmentFunction()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

enrichmentFunction(GOFunction)
enrichmentFunction()所属R语言包：GOFunction

                                         Identification of statistically significant GO terms
                                         统计学意义的GO术语的识别

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Using the hypergenomic distribution test and FDR correction procedure, this function can identify a set of statistically significant GO terms.
使用hypergenomic分布测试和FDR校正程序，此功能可以识别一组统计学意义的GO术语。


参数----------Arguments----------

参数：annRef
annRef is the annotated reference genes and their annotated terms.   
annRef注释参考基因及其注释的条款。


参数：annInterest
annInterest is the annotated interesting genes and their annotated terms.  
annInterest注明有趣的基因，并注明条款。


参数：method
method is the fdr method. GO-function provides three p value correction methods: "bonferroni", "BH"  and "BY". The default is "BY".  
method是FDR的方法。 GO功能提供三个P值校正方法：“邦弗朗尼”，“波黑”和“”。默认是“通过”。


参数：fdrth
fdrth is the fdr cutoff to identify statistically significant GO terms. The default is 0.05.  
fdrth是FDR截止到确定统计学意义的GO术语。默认是0.05。


值----------Value----------

The function returns a list contained two values: The first value is a table contained the information of all statistically significant terms under a FDR control level and the second value is a table contained the information  of all annotated GO terms.
该函数返回一个列表包含两个值：第一个值是一个表中的所有统计学意义的条款下FDR控制水平的信息，第二个值是一个表中包含的所有注释的GO术语的信息。


作者（S）----------Author(s)----------



Jing Wang




参见----------See Also----------

GOFunction
GOFunction

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。