regressionplot(globaltest)
regressionplot()所属R语言包：globaltest
Regression Plot for Global Test (Deprecated)
全球测试（已回归图）
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Produces a plot which can be used to visualize the effect of specific samples on the test result produced by
产生一个特定样本的影响，对所生产的测试结果可用于可视化的图
用法----------Usage----------
regressionplot(gt, geneset, sampleid, ...)
参数----------Arguments----------
参数：gt
The output of a call to globaltest.
输出调用globaltest的。
参数：geneset
The name or number of the geneset to be plotted (only necessary if multiple genesets were tested).
名称或geneset的数量要绘制（只有必要的，如果多个genesets被测试）。
参数：sampleid
An optional vector of names or numbers of the samples of interest.
一个名称或利益样品数可选向量。
参数：...
Any extra arguments will be forwarded to the plotting function. </table>
任何额外的参数将被转发到绘图功能。 </ TABLE>
Details
详情----------Details----------
The regressionplot plots, for all pairs of samples, the covariance between the expression patterns against the covariance between their clinical outcomes. Each point in the plot therefore represents a pair of samples. A regression line is fitted through the samples, which visualizes the test result of the function globaltest. A steeply increasing slope indicates a high (possibly significant) value of the test statistic.
regressionplot图，对所有样品，对他们的临床结果之间的协方差的表达模式之间的协方差。每个图点，因此代表了一双样品。一个装有回归线通过的样品，其中形象化功能globaltest的测试结果。一个急剧增加的斜率表示的检验统计量的高值（可能显着）。
An optional argument sampleid can be supplied, giving sample numbers of possibly outlying arrays. In this case, all pairs of arrays involving one of the arrays in sampleid is marked as a red cross, while the other pairs are marked as a blue dot. The blue line which is fitted through all points can now be compared to a red dotted line which is fitted though only the red
一个可选的参数sampleid，可提供给可能的外围阵列的样本数。在这种情况下，对所有涉及sampleid阵列之一的阵列被标记为一个红色的叉，而另一对标记为一个蓝点。蓝线是通过装上所有的点，现在可以进行比较，以红色虚线，这是装上虽然只有红色
值----------Value----------
NULL (no output).
NULL（无输出）。
注意----------Note----------
regressionplot has been deprecated. Please use subjects instead.
regressionplot已被弃用。请使用subjects代替。
Regressionplot does not work if the adjusted version of
regressionplot不起作用，如果调整后的版本
作者（S）----------Author(s)----------
Jelle Goeman: <a href="mailto:j.j.goeman@lumc.nl">j.j.goeman@lumc.nl</a>; Jan Oosting
参考文献----------References----------
van Houwelingen, 2004, A global test for groups of genes: testing association with a clinical outcome, Bioinformatics 20 (1) 93–99. See also the How To
参见----------See Also----------
globaltest, sampleplot,
globaltest，sampleplot
举例----------Examples----------
# Breast cancer data (ExpressionSet) from the Netherlands Cancer[从荷兰癌症乳腺癌数据（ExpressionSet）]
# Institute with annotation:[研究所与注释：]
data(vandeVijver)
data(annotation.vandeVijver)
gt <- globaltest(vandeVijver, "ESR1", annotation.vandeVijver)
if (interactive()) {
regressionplot(gt[1])
regressionplot(gt[1], sampleid = "122")
}
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发表于 2012-2-25 20:45:33
