R语言 GLAD包 as.profileCGH()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

as.profileCGH(GLAD)
as.profileCGH()所属R语言包：GLAD

                                        Create an object of class profileCGH
                                         创建类profileCGH对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create an object of class profileCGH.
创建类profileCGH对象。


用法----------Usage----------


as.profileCGH(object,...)
## S3 method for class 'data.frame'
as.profileCGH(object, infaction=c("value","empty"),
value=20, keepSmoothing=FALSE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
A data.frame to be convert into profileCGH.
数据框被转换成profileCGH。


参数：infaction
If "value" then the LogRatio with infinite values (-Inf, Inf) are replace by + or - value according to the sign. If "empty" then NAs are put instead.
如果“价值”，然后与无限值（-INF，INF）的对数比取代+或 - value根据标志。如果“空”，然后NAS放在代替。


参数：value
replace Inf by value if infaction is "value".
替换INFvalueinfaction是“价值”。“


参数：keepSmoothing
if TRUE the smoothing value in object is kept
如果为true，在对象的平滑值保持


参数：...
...
...


Details

详情----------Details----------

The data.frame to be convert must at least contain the following fields: LogRatio, PosOrder, and Chromosome. If the field Chromosome is of mode character,  it is automatically converted into a numeric vector (see ChrNumeric); a field ChromosomeChar contains the character labels. The data.frame to be converted into a profileCGH objet is split into two data.frame: profileValuesNA contains the rows for which there is at least a missing value for either
被转换成数据框必须至少包含以下字段：对数比，PosOrder，染色体。如果该字段染色体模式字符，它会自动转换成一个数值向量（见ChrNumeric）;字段ChromosomeChar包含的字符标签。的数据框，将转换成profileCGH OBJET被分裂成两个数据框：profileValuesNA包含行，其中有至少一个或者丢失的价值


值----------Value----------


参数：
A list with the following attributes
具有下列属性的列表


参数：profileValues
A data.frame
数据框


参数：profileValuesNA
A data.frame
数据框


注意----------Note----------

People interested in tools dealing with array CGH analysis can
在处理与阵列比较基因组杂交分析工具有兴趣的人可以


作者（S）----------Author(s)----------


Philippe Hup