getBiocPlatformMap(GEOmetadb)
getBiocPlatformMap()所属R语言包:GEOmetadb
Get mappings between GPL and Bioconductor microarry annotation packages
获取之间GPL和Bioconductor芯片研究注解包的映射
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Query the gpl table and get GPL information of a given list of Bioconductor microarry annotation packages. Note currently the GEOmetadb does not contains all the mappings, but we are trying to construct a relative complete list.
查询GPL表,并得到GPL Bioconductor芯片研究注解包一个给定的列表信息。注意:目前的GEOmetadb不包含所有的映射,但我们正在努力构建一个相对完整的列表。
用法----------Usage----------
getBiocPlatformMap(con, bioc='all')
参数----------Arguments----------
参数:con
Connection to the GEOmetadb.sqlite database
连接的GEOmetadb.sqlite数据库
参数:bioc
Character vector of Biocondoctor microarry annotation packages, e.g. c('hgu133plus2','hgu95av2'). 'all' returns all mappings.
特征向量Biocondoctor芯片研究注解包,例如C(“hgu133plus2,hgu95av2”)。 所有返回所有映射。
值----------Value----------
A six-column data.frame including GPL title, GPL accession, bioc_package, manufacturer, organism, data_row_count.
六列数据框包括GPL称号,GPL的加入,bioc_package,制造商,生物,data_row_count。
作者(S)----------Author(s)----------
Jack Zhu <zhujack@mail.nih.gov>, Sean Davis <sdavis2@mail.nih.gov>
参考文献----------References----------
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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