R语言 genoset包 segTable-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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segTable-methods(genoset)
segTable-methods()所属R语言包：genoset

                                        Convert Rle objects to tables of segments...
                                         转换RLE段表的对象...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Convert Rle objects to tables of segments
RLE对象转换段表


参数----------Arguments----------

参数：object
Rle or list/DataFrame of Rle vectors
RLE或列表/ RLE向量DataFrame


参数：locs
RangedData with rows corresponding to rows of df
DF的行与行相应RangedData


参数：sample.name
character for single Rle optionally include "ID" column with this sample name
单RLE字符可选，包括“身份证”与此样品名称列


Details

详情----------Details----------

Like the inverse of segs2Rle and segs2RleDataFrame. Takes a Rle or a DataFrame with Rle columns and the locData RangedData both from a GenoSet object and make a list of data.frames each like the result of CBS's segment.  Note the loc.start and loc.stop will correspond exactly to probe locations in locData and the input to
像逆segs2Rle和segs2RleDataFrame。需要与的RLE列和无论从GenoSet对象，和使每个像CBS的部分结果data.frames名单locData RangedData RLE或DataFrame。注意将对应的loc.start和loc.stop完全在locData探针的位置，并输入到


值----------Value----------

one or a list of data.frames with columns ID, chrom, loc.start, loc.end, num.mark, seg.mean
一个或一列ID，CHROM，loc.start，loc.end，num.mark，seg.mean data.frames列表


作者（S）----------Author(s)----------


Peter M. Haverty



举例----------Examples----------


seg.list = runCBS( lrr(baf.ds), locData(baf.ds), return.segs=TRUE )
df = segs2RleDataFrame( seg.list, locData(baf.ds) )  # Loop segs2Rle on list of data.frames in seg.list[循环segs2Rle对seg.list data.frames列表]
assayDataElement( baf.ds, "lrr.segs" ) = df
segTable( df, locData(baf.ds) )
segTable( assayDataElement(baf.ds,"lrr.segs"), locData(baf.ds) )

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注：
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