R语言 genoset包 orderedChrs()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

orderedChrs(genoset)
orderedChrs()所属R语言包：genoset

                                        Get chromosome names in genome order...
                                         获得染色体的基因顺序的名字......

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get chromosome names in genome order
获得染色体的基因顺序名称


参数----------Arguments----------

参数：object
GenoSet or RangedData
GenoSet或RangedData


Details

详情----------Details----------

orderedChrs-methods: Get chromosome names from locData data in a GenoSet.  Order numerically, for numeric chromosomes, then lexically for the rest.
orderedChrs-methods：获取从locData在GenoSet数据的染色体的名字。订单数字，数字的染色体，然后词法的截断。


值----------Value----------

orderedChrs-methods: character vector with chrs in genome order
orderedChrs-methods：CHRS基因顺序与特征向量


作者（S）----------Author(s)----------


Peter M. Haverty



举例----------Examples----------


probe.names = letters[1:10]
gs = GenoSet(
locData=RangedData(ranges=IRanges(start=1:10,width=1,names=probe.names),space=c(rep("chr1",4),rep("chrX",2),rep("chr3",4)),universe="hg18"),
cn=matrix(31:60,nrow=10,ncol=3,dimnames=list(probe.names,test.sample.names)),
pData=data.frame(matrix(LETTERS[1:15],nrow=3,ncol=5,dimnames=list(test.sample.names,letters[1:5]))),
annotation="SNP6"
)
orderedChrs(gs) # c("chr1","chr3","chrX")[C（chr1“，”chr3“，”chrX“）]

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注：
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