convertToBigMatrix(genoset)
convertToBigMatrix()所属R语言包:genoset
Make standard matrices in a GenoSet filebacked bigmatrix objects...
请在GenoSet的filebacked bigmatrix对象的标准矩阵...
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Make standard matrices in a GenoSet filebacked bigmatrix objects
在GenoSet的filebacked bigmatrix对象的标准矩阵
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:object
GenoSet
GenoSet
参数:prefix
character, prefix for all bigmatrix related files
所有bigmatrix相关文件,前缀字符
参数:path
character, directory to be created for all bigmatrix files, can be pre-existing.
字符,目录创建所有bigmatrix文件,可以是预先存在的。
Details
详情----------Details----------
Make standard matrices in a GenoSet filebacked bigmatrix objects. Something like a factor can be obtained using integer assayDataElements with a "levels" attribute. The levels attribute will be maintained. Such objects will be stored as char on disk if there are < 128 levels, and integer otherwise. "nlevels" and "levels" will work on these objects as they only require the levels attribute. The "as.character" functionality of a factor can be obtained like this: levels(assayDataElement(ds,"geno"))[ ds[1:5,1:5,"geno"] ]
在GenoSet的filebacked bigmatrix对象的标准矩阵。像一个因素可以得到使用整数assayDataElements一个“层次”属性。各级属性将保持不变。这些对象将存储在磁盘上,如果有<128的水平,否则整数为char。的“nlevels”和“水平”工作,对这些对象,因为它们只需要各级属性。 “as.character”功能,可以得到这样的一个因素:水平(assayDataElement(DS,“基因型”))[DS [1:5,1:5,“基因型”]
值----------Value----------
GenoSet or related, updated copy of "object"
GenoSet或相关的,更新的“对象”的副本
作者(S)----------Author(s)----------
Peter M. Haverty <a href="mailto:phaverty@gene.com">phaverty@gene.com</a>
举例----------Examples----------
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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