ncbiSubmit(genomes)
ncbiSubmit()所属R语言包：genomes
NCBI submission dates
NCBI提交日期
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Returns the date a sequence was submitted to NCBI using the Direct Submission line in the GenBank file
返回序列被提交到NCBI的日期，使用在GenBank文件直接提交行
用法----------Usage----------
ncbiSubmit(term, db = "nuccore", retmax = 1000)
参数----------Arguments----------
参数：term
Any valid combination of Entrez search terms or a vector of accessions numbers
Entrez的搜索字词或向量的加入数字的任何有效组合
参数：db
Entrez sequence database to search, default nuccore
Entrez的序列数据库进行搜索，默认nuccore
参数：retmax
Number of records to return
返回的记录数
Details
详情----------Details----------
Searches an Entrez sequence database, downloads GenBank files and parses the JOURNAL line containing a submitted date, for example, JOURNAL Submitted (03-SEP-1999) ....
搜索Entrez的序列数据库，下载序列文件，并解析作者：行包含一个提交日期，例如，“JOURNAL Submitted (03-SEP-1999) ...。
值----------Value----------
a data.frame with accession, definition, and submitted date
与加入的定义，并提交日期的数据框
注意----------Note----------
If more than two submitted dates are found, then the earliest date is returned
如果发现了两个以上的提交日期，然后返回的最早日期
作者（S）----------Author(s)----------
Chris Stubben
参见----------See Also----------
ncbiRelease)
ncbiRelease）
举例----------Examples----------
#Yersinia pestis in Genome database[鼠疫菌的基因组数据库]
ncbiSubmit("Yersinia pestis CO92[ORGN]", db="genome")
# Virus in nucleotide database[病毒在核苷酸数据库]
ebola<- ncbiSubmit("Ebolavirus[ORGN] NOT gbdiv_pat[PROP] NOT refseq[FILTER]")
head(ebola)
# a few early submissions may be missing[一些早期的意见可能会丢失]
subset(ebola, is.na(submitted))
table(year(ebola$submit))
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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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发表于 2012-2-25 19:25:01
