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R语言 genomes包 genomes-update()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:23:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
genomes-update(genomes)
genomes-update()所属R语言包:genomes

                                         Genome table updates
                                         基因表更新

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generic function for updating genome tables.  
基因表更新的通用功能。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'genomes'
update(object, ...)



参数----------Arguments----------

参数:object
a genomes data frame to update  
1的基因组数据框更新


参数:...
additional arguments are currently ignored  
目前被忽略额外的参数


Details

详情----------Details----------

update will retrieve the new genome table using the update string in attr(object, 'update').  The new table will replace the existing version,  but not permanently, since reloading the dataset using data will restore the older version.  If you have write permission, one option is to use system.file to replace the data set (see the example below).
update会attr(object, 'update')更新字符串获取新的基因表。新表将取代现有的版本,但不是永久的,因为重装使用data将恢复旧版本的数据集。如果你有写权限,办法之一是使用system.file更换一组数据(见下面的例子)。


值----------Value----------

Returns the updated genome table and a count of the number of new IDs added and old IDs removed.   Old IDs are typically assembly genomes in NCBI tables that have been released as a single complete genome.
返回更新后的基因组表和一些新的ID计数,并删除旧ID。旧ID通常是作为一个单一的完整的基因组已公布的基因组大会在NCBI表。


作者(S)----------Author(s)----------


Chris Stubben



参见----------See Also----------

genomes-summary, genomes-plot
genomes-summary,genomes-plot


举例----------Examples----------


## Not run: data(lproks)[#不运行:数据(lproks)]
## Not run: update(lproks)[#不运行:更新(lproks)]

# to replace the data set permanently[以取代永久设置的数据]
x <- system.file("data", "lproks.rda", package="genomes")
x
## Not run: save(lproks, file=x)[#无法运行:保存(lproks,文件= X)]


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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