R语言 genomes包 enaTaxonomy()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

enaTaxonomy(genomes)
enaTaxonomy()所属R语言包：genomes

                                         ENA taxonomy statistics
                                         ENA的分类统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The number of linked records and total size in the taxonomy portal view at the European Nucleotide Archive (ENA)
在欧洲核苷酸档案分类的门户视图（ENA）的联系记录和总规模


用法----------Usage----------


enaTaxonomy(tax, h = TRUE, round = 0)



参数----------Arguments----------

参数：tax
a taxonomy ID or name  
分类编号或名称


参数：h
return bases in human-readable format  
返回碱基在人类可读的格式


参数：round
number of digits to round bases
位数全面碱基的


值----------Value----------

a data.frame listing direct and subtree records in eight data classes: Assembled Nucleotide Sequences (release), Annotated Nucleotide Sequence update (std_update), Whole Genome Shotgun Sequence update (wgs_update), Genomic Contig Sequence update (con_update), Protein-coding Sequences (cds), Trace Archive (trace), SRA samples (sra_sample) and Projects (project).
数据框上市直接和子树记录在8个数据类：（释放）组装的核苷酸序列，核苷酸序列说明更新（std_update），更新（wgs_update）全基因组鸟枪序列，基因组重叠群序列更新（con_update），蛋白编码序列（CDS），档案跟踪（跟踪），SRA样本（sra_sample）的项目（项目）。


注意----------Note----------

The ENA urls require a taxonomy ID and therefore searching by a taxonomy name will be slower
ENA的网址需要分类的ID，因此，分类名称会比较慢


作者（S）----------Author(s)----------


Chris Stubben



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


# COMPARE to http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/display=html&amp;Taxon:2[比较到http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/display=html&amp;Taxon:2]
enaTaxonomy("Bacteria")
# common names [通用名称]
enaTaxonomy("human")
# root[根]
enaTaxonomy(1)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。