R语言 genomeIntervals包 interval_union()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

interval_union(genomeIntervals)
interval_union()所属R语言包：genomeIntervals

                                        Genome interval set operations
                                         基因组间隔设置操作

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute interval set operations on "Genome_intervals" or "Genome_intervals_stranded" objects.
计算间隔"Genome_intervals"或"Genome_intervals_stranded"对象集合操作。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'Genome_intervals'
interval_union(x, ...)
## S4 method for signature 'Genome_intervals_stranded'
interval_union(x, ...)

## S4 method for signature 'Genome_intervals'
interval_complement(x)
## S4 method for signature 'Genome_intervals_stranded'
interval_complement(x)

## S4 method for signature 'Genome_intervals'
interval_intersection(x,...)
## S4 method for signature 'Genome_intervals_stranded'
interval_intersection(x,...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A "Genome_intervals" or "Genome_intervals_stranded" object.
一个"Genome_intervals"或"Genome_intervals_stranded"对象。


参数：...
Optionally, additional objects of the same class as x.
或者，为x同一类的其他对象。


Details

详情----------Details----------

Wrappers calling the corresponding functions of the package intervals by  same seq_name, inter_base and if needed strand. Note that the    union of single input object x returns the reduced form of x, i.e. the interval representation of the covered set.
包装调用相应的功能包intervals由seq_name，inter_base“如果需要的话strand。需要注意的是单输入对象的工会x返回x的简化形式，即覆盖集的间隔表示。


值----------Value----------

A single object of appropriate class, representing the union, complement or intersection of intervals computed over entries with same seq_name, inter_base and  also strand if all passed objects are of the class "Genome_intervals_stranded".
一个适当的类的单个对象，代表工会，补充或以上条目计算的时间间隔相同seq_name，inter_base和strand如果全部通过对象类的<X路口>


参见----------See Also----------

interval_union, interval_complement, interval_intersection and reduce from the package intervals.
interval_union，interval_complement，interval_intersection和reduce包intervals。


举例----------Examples----------


## load toy examples[＃装载玩具的例子。]
data(gen_ints)
## content of i object[＃我反对的内容]
i
         
## complement[＃补充]
interval_complement(i)

## reduced form (non-overlapping interval representation of the covered set)[＃减少表格（非重叠覆盖集的间隔表示）]
interval_union(i)

## union[＃工会]
interval_union(i[1:2,], i[1:4,])

# map to genome intervals and union again[映射到基因组的间隔和工会再次]
i.nostrand = as(i,"Genome_intervals")
interval_union(i.nostrand)

## intersection with a second object[＃第二个对象的交点]
# print i and j in closed interval notation[打印在闭区间表示i和j]
close_intervals(i)
close_intervals(j)

# interval_intersection[interval_intersection]
interval_intersection(i,j)

#interval intersection non-stranded[间隔交叉口非股]
interval_intersection(i.nostrand, as(j, "Genome_intervals"))

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