R语言 GenomeGraphs包 makeTranscript()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

makeTranscript(GenomeGraphs)
makeTranscript()所属R语言包：GenomeGraphs

                                        Creates an object of class Transcript
                                         创建一个谈话类的对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an object of class Transcript.  This represents all known transcript structures in Ensembl.
创建一个谈话类的对象。这代表在Ensembl的所有已知的转录结构。


用法----------Usage----------


makeTranscript(id, type, biomart, dp = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：id
An identifier used to specify of which gene/transcript the transcript structures should be retrieved
基因/转录的转录结构应撷取用于指定一个标识符


参数：type
The type of identifiers used, examples are ensembl\_gene\_id, hgnc\_symbol,entrezgene. See listAttributes function of thebiomaRt package for more info
类型的标识符使用的例子是ENSEMBL \ _gene \的_id，hgnc \ _symbol，entrezgene。更多listAttributes thebiomaRt包的功能


参数：biomart
Mart object, created by the useMart function of biomaRt
沃尔玛对象，创建由biomaRt useMart功能


参数：dp
object of class DisplayPars, determines the display of features on the plot
类DisplayPars对象，决定对图显示功能


值----------Value----------

An object of class Transcript
一个谈话类的对象


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Durinck and Jim Bullard



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


##---- Should be DIRECTLY executable !! ----[＃----应直接执行！！ ----]
##-- ==&gt;  Define data, use random,[ -  ==>定义数据，使用随机的，]
##--        or do  help(data=index)  for the standard data sets.[＃ - 或做帮助的标准数据集（数据索引）。]

## The function is currently defined as[＃函数定义为]
function (id, type, biomart, dp = NULL)
{
    if (missing(id))
        stop("Need to specify a gene identifier for creating a Transcript")
    pt <- getClass("Transcript")@prototype
    if (is.null(dp))
        dp <- pt@dp
    if (missing(type))
        type = pt@type
    new("Transcript", id = id, type = type, biomart = biomart,
        dp = dp)
  }

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。