GeneModel-class(GenomeGraphs)
GeneModel-class()所属R语言包:GenomeGraphs
Class "GeneModel", represents a custom gene model
类“GeneModel”,代表了自定义的基因模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This class represents a custom gene model defined by exon boundaries. An example of this class could be an Affymetrix gene model used to create the Affy Exon array
这个类表示一个自定义的基因外显子边界模型定义。这个类的一个例子是用于创建Affy外显子阵列Affymetrix基因模型
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created by calls of the form new("GeneModel", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("GeneModel", ...)。
插槽----------Slots----------
exonStart: Object of class "numeric", vector containing the start positions of the exons that are to be drawn
exonStart:Object类的"numeric",向量外显子的起始位置,将提请
exonEnd: Object of class "numeric", vector containing the end positions of the exons that are to be drawn
exonEnd:Object类的"numeric",向量外显子的末端位置,将提请
chromosome: Object of class "numeric" , chromosome name
chromosome:对象类"numeric",染色体的名字
dp: Object of class "DisplayPars", color of the exons and size of the exon model in the final plot
dp类"DisplayPars",外显子和外显子模型的大小,颜色对象在最后图
方法----------Methods----------
No methods defined with class "GeneModel" in the signature.
没有任何方法定义类的“GeneModel”签名。
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Durinck
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
data("unrData", package="GenomeGraphs")
affyModel = new("GeneModel", exonStart = unrPositions[,3], exonEnd = unrPositions[,4])
gdPlot(list(affyModel), minBase = min(unrPositions[,3]), maxBase=max(unrPositions[,4]))
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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