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R语言 GeneSelector包 RankingWelchT()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:04:30 | 显示全部楼层 |阅读模式
RankingWelchT(GeneSelector)
RankingWelchT()所属R语言包:GeneSelector

                                        Ranking based on the Welch t statistic.
                                         韦尔奇的t统计排名的基础上。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Performs univariate (rowwise) Welch tests on a gene expression matrix. The Welch t statistic is a better alternative to the  'ordinary' t statistic in the two sample, unequal variances setting.
执行单因素(rowwise)基因表达矩阵韦尔奇测试。韦尔奇的t统计量是一个更好的选择在“普通”的t统计量的两个样本,设置不平等的差异。


用法----------Usage----------


RankingWelchT(x, y, type = "unpaired", pvalues = TRUE, gene.names = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数:x
A matrix of gene expression values with rows corresponding to genes and columns corresponding to observations or alternatively an object of class ExpressionSet.
一个matrix基因表达值与相应的基因和相应的意见,或者一个对象类ExpressionSet列行。


参数:y
If x is a matrix, then y may be a numeric vector or a factor with at most two levels.<br> If x is an ExpressionSet, then y is a character specifying the phenotype variable in the output from pData.
x如果是一个矩阵,然后y可能是一个numeric矢量或在大多数两个级别的一个因素。参考如果x是ExpressionSet ,然后y是一个字符指定在pData输出型变量。


参数:type
Only the two sample case, type="unpaired" is possible. Otherwise, use RankingTstat. Variances are assumed to be unequal.
只有两个样本的情况下,type="unpaired"是可能的。否则使用RankingTstat。差异被认为是不平等的。


参数:pvalues
Should p-values be computed ? Default is TRUE.
应的p值计算?默认TRUE。


参数:gene.names
An optional vector of gene names.
一个基因名称可选的向量。


参数:...
Currenly unused argument.
currenly未使用的参数。


值----------Value----------

An object of class GeneRanking.
对象类GeneRanking。


作者(S)----------Author(s)----------


Martin Slawski <br>
Anne-Laure Boulesteix



参见----------See Also----------

RepeatRanking, RankingTstat, RankingFC,  RankingWilcoxon, RankingBaldiLong, RankingFoxDimmic, RankingLimma,  RankingEbam, RankingWilcEbam, RankingSam,  RankingShrinkageT, RankingSoftthresholdT,
RepeatRanking,RankingTstat,RankingFC,RankingWilcoxon,RankingBaldiLong,RankingFoxDimmic,RankingLimma,RankingEbam,RankingWilcEbam,RankingSam,RankingShrinkageT,RankingSoftthresholdT


举例----------Examples----------


## Load toy gene expression data[#加载玩具基因表达数据]
data(toydata)
### class labels[##类的标签]
yy <- toydata[1,]
### gene expression[##基因表达]
xx <- toydata[-1,]
### run RankingWelch[#运行RankingWelch]
welchT <- RankingWelchT(xx, yy, type="unpaired")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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