R语言 GeneRegionScan包 readGeneInput()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readGeneInput(GeneRegionScan)
readGeneInput()所属R语言包：GeneRegionScan

                                        Standardize reading of gene inputs
                                         规范基因输入的阅读

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Internal function that will standardise the input of the many different form of sequences that can be used in Bioconductor.
内部功能，将规范Bioconductor可以在使用序列的许多不同的形式输入。


用法----------Usage----------


readGeneInput(gene, genename=NULL, verbose=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：gene
A number of gene sequences as DNAString, list of DNAString objects, character-vectors or readFASTA outputs.  
一个基因序列作为DNAString，列表DNAString对象，字符矢量或readFASTA输出的数量。


参数：genename
Optional character string specifying a gene name to include in the plot. If not included and a FASTA sequence is given, it will default to the name in the FASTA sequence. Otherwise it will default to 'Unknown genename'.  
可选的字符串指定一个基因的名字，包括图。如果不包含，并给出一个FASTA序列，它会默认为FASTA格式的序列的名称。否则，它会默认为未知genename“。


参数：verbose
TRUE or FALSE.
TRUE或FALSE。


Details

详情----------Details----------

This function is not meant to be run directly by the user. It will take a number of genes either as a vector  of characters, a path to a FASTA format file, as a vector of DNAstrings or as a readFASTA format. It will then output  them in FASTA format for use with other functions. Optional variable genename forces a new name.
此功能并不意味着要由用户直接运行。这将需要的基因的数量，无论是作为向量的字符，FASTA格式的文件的路径作为一个DNAstrings向量或作为readFASTA格式的。然后，它会与其他功能的使用，他们在FASTA格式输出。可选变量的genename强制一个新的名字。

The primary objective of this function is to make the sequence input simpler for other functions.
这个函数的主要目的是使简单的序列输入等功能。


值----------Value----------

A list of all sequences and their names, in exactly the same format as obtained with the readFASTA function of the Biostrings package.
所有序列和他们的名字，在相同的格式，与的Biostrings包readFASTA功能得到。


作者（S）----------Author(s)----------


Lasse Folkersen



参见----------See Also----------

geneRegionScan, plotOnGene
geneRegionScan，plotOnGene


举例----------Examples----------



        somegene<-"ATACCTTGTAGGACCTGATGATAGATGCATAGTAATATCGTA"
        genename<-"My favourite gene"
        GeneRegionScan:::readGeneInput(somegene,genename=genename)


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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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