R语言 GeneRegionScan包 doProbeTTest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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doProbeTTest(GeneRegionScan)
doProbeTTest()所属R语言包：GeneRegionScan

                                        Do Probe T-Test
                                         做探针ţ试验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Internal function used to calculate t-tests between probe level intensity and pData entries with two levels.
内部函数用于计算两个层次之间的探针水平强度和pData项的t-检验。


用法----------Usage----------


    doProbeTTest(object, label, testType="students")



参数----------Arguments----------

参数：object
A ProbeLevelSet object or a regular ExpressionSet object.
一个ProbeLevelSet对象或定期ExpressionSet对象。


参数：label
An optional character string specifying a column name in the pData of the object. If this argument is given, the gene plot will be colour coded based on the different groups (factors) in the pData entry. If a summaryType other than 'dots' is selected the summarisation is done stratified by the different groups in the pData.     
一个可选的字符串对象的pData所指定的列名。如果这种说法，基因图将根据不同的群体，在PDATA项（因素）的颜色编码。如果选择“点”以外summaryType的summarisation完成在pData所不同群体分层。


参数：testType
Character string, defining a statistic procedure to identify especially interesting probes.
字符串，定义一个统计程序，以确定特别有趣的探针。


Details

详情----------Details----------

This function is not meant to be called by the user. It does the statistical calculations when called by plotStatistics
此功能并不意味着必须由用户调用。它做称为plotStatistics的统计计算


值----------Value----------

A correlation list with p-value and fold-change in columns and probe IDs as rownames. Used by plotStatistics when decorating plots from plotOnGene.
与p值在列作为rownames的探针标识的fold change的相关名单。时由plotStatistics使用从plotOnGene装饰图。


作者（S）----------Author(s)----------


Lasse Folkersen



参见----------See Also----------

plotStatistics, plotOnGene
plotStatistics，plotOnGene


举例----------Examples----------



        data(exampleProbeLevelSet)
        colnames(pData(exampleProbeLevelSet))
        tTestData<-GeneRegionScan:::doProbeTTest(exampleProbeLevelSet,"gender")
        colnames(tTestData)
       
        #P value for the probe with ID 679083 in relation to "gender"[P值探针有关“性别”与编号679083]
        print(tTestData["679083","p-value"])


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