R语言 geneplotter包 groupedHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

groupedHeatmap(geneplotter)
groupedHeatmap()所属R语言包：geneplotter

                                        Heatmap of a matrix with grouped rows and columns
                                         热图的一个分组的行和列的矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function uses grid.rect and grid.rect to draw a heatmap with grouped rows and columns.
该功能使用了grid.rect和grid.rect热图绘制分组的行和列。


用法----------Usage----------


groupedHeatmap(z, frow, fcol,
  fillcolours = c("#2166ac","#4393c3","#92c5de","#d1e5f0","#fefefe","#fddbc7","#f4a582","#d6604d","#b2182b"),
  bordercolour = "#e0e0e0",
  zlim = range(z, na.rm=TRUE))



参数----------Arguments----------

参数：z
A matrix with row and column names.
一个矩阵的行和列名。


参数：frow
A factor of length nrow(z) indicating the row grouping.
一个factor长度nrow(z)指示行分组。


参数：fcol
A factor of length ncol(z) indicating the column grouping.
一个factorncol(z)指示列分组长度。


参数：fillcolours
A character vector of colours from which the colour map is obtained through interpolation.  
一个character矢量彩色图通过插值得到的颜色。


参数：bordercolour
Either a character vector of length 1, specifying the border colour of the heatmap tiles, or NULL or NA, which indicates that the border colour should match the fill colour.  
character向量长度为1，指定的热图瓷砖的边框颜色，或NULL或NA，这表明，边框的颜色应与填充颜色。


参数：zlim
Lower and upper limit of z values represented in the colour map.
z在彩色图上表示的值的下限和上限。


Details

详情----------Details----------

The function can be called within other drawing operations from the grid package, e.g. within a viewport.
函数可以被称为网格包内其他绘图操作，例如：在视口中。


值----------Value----------

The function is called for its side effect, drawing text and
调用该函数绘制文本和它的副作用，


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber <a href="http://www.ebi.ac.uk/huber">http://www.ebi.ac.uk/huber</a>



参见----------See Also----------

grid.text, grid.rect
grid.text，grid.rect


举例----------Examples----------



data("mtcars")

groupedHeatmap(
  scale(mtcars),
  frow = factor(sapply(strsplit(rownames(mtcars), " "), "[", 1)),
  fcol = factor(round(seq_len(ncol(mtcars))/3)))

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