dstar(GeneMeta)
dstar()所属R语言包:GeneMeta
Tools for Meta-analysis of gene expression data.
Meta分析基因表达数据的工具。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A small number of meta-analysis functions for comparing two gene expression experiments are provided.
提供一个荟萃分析功能比较两种基因表达的实验少数。
用法----------Usage----------
dstar(d, n)
getdF(data, categ)
sigmad(d, ng1, ng2)
参数----------Arguments----------
参数:d
A vector of t-statistics, i.e. the output of getdF.
t-统计量的一个向量,即输出getdF。
参数:n
The number of t-statistics.
t-统计的数字。
参数:data
The data used to compute t-statistics, either a matrix or an ExpressionSet.
用于计算t-统计的数据,无论是matrix或ExpressionSet。
参数:categ
A vector of 0's and 1's indicating group membership.
0和1的组成员表示向量。
参数:ng1
The number of samples in group 1.
在第1组样品的数量。
参数:ng2
The number of samples in group 2.
在第2组样品的数量。
Details
详情----------Details----------
The functions getdF compute t-test statistics for the input data and group membership (note that group membership must be indicated by a vector of 0's and 1's).
职能getdF计算t检验的统计数据,输入数据和组成员(注组成员必须由0和1的向量表示)。
The function dstar computes an unbiased estimate of the t-test. The function sigmad computes the variance estimate of dstar.
功能dstar计算t检验无偏估计。功能sigmad计算方差估计dstar。
值----------Value----------
The different functions have different return values, but generally they are vectors of the requested quantities.
不同的功能有不同的返回值,但一般来说,他们所要求的数量的向量。
作者(S)----------Author(s)----------
L. Lusa, R. Gray and R. Gentleman
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
x = matrix(rnorm(1000), ncol=10)
ds = getdF(x, rep(c(0,1), c(5,5)))
dst = dstar(ds, ncol(x))
sgd = sigmad(ds, 5, 5)
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