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R语言 GeneAnswers包 getHomoGeneIDs()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:39:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
getHomoGeneIDs(GeneAnswers)
getHomoGeneIDs()所属R语言包:GeneAnswers

                                         Get homologous genes of given genes
                                         获取特定基因的同源基因

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Map given gene IDs to homologous gene IDs.
图给基因标识同源基因标识。


用法----------Usage----------


getHomoGeneIDs(oriGeneIDs, species = c("human", "rat", "mouse", "yeast", "fly"), speciesL = c("human", "rat", "mouse", "yeast", "fly"), mappingMethod = c("direct", "biomaRt", "none"))



参数----------Arguments----------

参数:oriGeneIDs
a given entrez gene IDs  
一个给定的Entrez基因身份证


参数:species
species of the current genes  
目前基因种


参数:speciesL
species of the mapped genes  
种映射的基因


参数:mappingMethod
mapping method, see details  
映射方法,查看详细信息


Details

详情----------Details----------

There are two mapping methods supported by current version. "direct" only works between human and mouse because most of human gene symbols are capitalized and only the first letter is uppercase for those homogenes in mouse. Another way is by means of package "biomaRt" ,which contains more information while the network connection is necessary to access biomaRt online server.
当前版本所支持的映射有两种方法。 “直接”只工作,因为大部分人类基因符号资本,并在鼠标的homogenes只有第一个字母是大写的人类和小鼠之间。另一种方法是通过包“biomaRt”,其中包含更多的信息,而网络连接是必要的访问biomaRt在线服务器。


值----------Value----------

return homologous gene IDs of given genes
返回特定基因同源基因标识


作者(S)----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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