R语言 GeneAnswers包 getGOList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getGOList(GeneAnswers)
getGOList()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Get GO list of given genes
                                         得到好特定的基因列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Retrieve GO IDs based on given gene IDs.
检索，根据给定的基因标识的标识。


用法----------Usage----------


getGOList(geneVector, lib, GOCat = c("ALL", "BP", "CC", "MF"), level = 1)



参数----------Arguments----------

参数：geneVector
a character vector containing entrez IDs  
Entrez的标识字符向量


参数：lib
annotation library  
注释库


参数：GOCat
type of Gene Ontology  
类型的基因本体论


参数：level
positive integer to specify how many levels GO IDs will be removed.  
正整数来指定多层次去标识将被删除。


Details

详情----------Details----------

User can specify which subtype of GO can be kept. "ALL" means all of subtypes are kept. Gene Ontology is a tree-like structure. Level can be used to remove top noncritical GO IDs.
用户可以指定可以保持好亚型。 “ALL”，意味着所有亚型都不停。基因本体论是一个树状结构。水平可以用来清除顶部不重要好标识。


值----------Value----------

return a GO list, whose names are GO IDs. Elements are gene entrez IDs belonging to the corresponding GO categories.
返回GO名单，他们的名字是好标识。元素是属于相应的GO类别的基因Entrez的标识。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


a <- getGOList(c('56458', '16590'), 'org.Mm.eg.db', GOCat='BP', level=2)
length(a)

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