R语言 GeneAnswers包 geneAnswersReadable()函数中文帮助文档(中英文对照)

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geneAnswersReadable(GeneAnswers)
geneAnswersReadable()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Make GeneAnswers Instance readable
                                         GeneAnswers讼可读

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

a function to mapping category IDs and gene IDs to names and symbols.
名称和符号的类别ID和基因标识映射功能。


用法----------Usage----------


geneAnswersReadable(x, catTerm = TRUE, geneSymbol = TRUE, strict = FALSE, verbose=TRUE, missing=c('name', 'keep', 'remove'), ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
a GeneAnswers instance containing category IDs and geneIDs  
1 GeneAnswers实例，其中包含的类别ID和geneIDs


参数：catTerm
logic value to determine whether mapping category IDs to names  
逻辑值，以确定是否映射的类别ID名称


参数：geneSymbol
logic value to determine whether mapping gene IDs to symbols  
逻辑值，以确定是否映射基因标识符号


参数：strict
logic value to determine whether interrupt conversion if NA is introduced.  
逻辑值，以确定是否中断转换，如果NA介绍。


参数：verbose
logical, show current stage or not
逻辑，显示现阶段或不


参数：missing
type of handling NA mapping.  
处理不适用类型映射。


参数：...
other parameters used by getCategoryTerms  
getCategoryTerms使用其他参数


Details

详情----------Details----------

Conversion could stop if NA is introduced and strict is set to TRUE. There are three types of parameters for variable 'missing'. 'name' means the NA mapping values are replaced by their names. 'keep' means all of NA values are kept. 'remove' means all of NA values are removed. Occationally, Reactome uses the same name for species-mixed pathways based on in vivo and in vitro experiments, so we highly recommend to set addID as TRUE for Reactome and caBIO test.
转换可能会停止，如果NA介绍和严格的设置为TRUE。有三种类型的参数变量失踪。 “名称”是指NA映射值由他们的名字所取代。 “保持”意味着所有的NA值保持。 “删除”指的NA值都将被删除。 ，Reactome occationally在体内和体外实验为基础的混合种途径使用相同的名称，所以我们强烈建议ADDID为TRUE为Reactome和caBIO测试设置。


值----------Value----------

return a GeneAnswers instance with category names and/or gene symbols.
返回类的名称和/或基因符号1 GeneAnswers实例。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


example(GeneAnswers)
xx <- geneAnswersReadable(x)

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注：
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