R语言 gene2pathway包 classificationModel()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

classificationModel(gene2pathway)
classificationModel()所属R语言包：gene2pathway

                                        Hierarchical Classification Model
                                         分层分类模型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This file contains the hierarchical classification model to predict KEGG pathway branches for genes. The model uses a pruned KEGG hierarchy, where metabolic pathways are not distinguished further, and the KEGG hierarchy for "cellular processes" and "genetic information processing" is pruned at the 2nd level. By default the model uses bagging to improve prediction accuracy. Important: There exists one separate model file for each organism.
这个文件包含了分层分类模型预测基因KEGG通路分行。该模型采用“单元过程”和“遗传信息处理”1 KEGG层次修剪，不区分进一步代谢途径，和KEGG层次修剪在第二级。默认情况下，该模型采用套袋，以提高预测的准确性。重要的是：每个生物体存在一个单独的模型文件。


格式----------Format----------

List of class "model", where each model has the following entries:
列表类的“模范”，其中每个模型有以下条目：




W learned decision hyperplane normal vector
W学会决定超平面的法向量




C dictionary of label vectors, which can be predicted individually or which can be used to predict combinations of them
Ç字典标签的向量，可以单独或预测可以用来预测它们的组合




detectors SVM models trained to separate one specific pathway branch from the rest of the hierarchy
探测器的SVM模型训练分开其余层次的一个具体途径分支




used\_domains InterPro domains used by the classifier to separate the specific branch from the rest of the hierarchy
使用\ _domains InterPro的分类层次的其余部分分开的具体分支领域




alldomains all InterPro domains used to build feature vectors
alldomains所有InterPro的域用于建立特征向量




allpathways hierarchy branches, which can be predicted
allpathways层次分支机构，可以预见




treesizes relative size of hierarchy below the corresponding branch
treesizes低于相应的分支层次相对大小




kegg\_hierarchy a nested list with information (parent branches, pathway names, pathway IDs, hierarchy level) on all higher hierarchy branches for each pathway
KEGG \ _hierarchy嵌套列表为每个通路与信息上所有较高层次的分支机构（父分行，通路名称，通路标识，层级）


作者（S）----------Author(s)----------


Holger Froehlich



参见----------See Also----------

classificationModelSignalTrans
classificationModelSignalTrans

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。