Zscore(genArise)
Zscore()所属R语言包:genArise
Z-scores for identifying differential expression
识别差异表达的Z分数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function identify differential expressed genes by calculating an intensity-dependent Z-score. This function use a sliding window to calculate the mean and standard deviation within a window surrounding each data point, and define a Z-score where Z measures the number of
此功能由依赖强度的Z-score模型计算确定差异表达的基因。这个函数使用一个滑动窗口计算在窗口周围的每个数据点的平均值和标准偏差,定义一个Z-得分,其中Z措施的数量
用法----------Usage----------
Zscore(spot.object,type,window.size)
参数----------Arguments----------
参数:spot.object
A spot object
A点对象
参数:type
Type of analysis: "ri" is for a R-I analysis and "ma" is for M-A analysis
类型的分析:“里”是一个RI分析和“马”为马分析
参数:window.size
Size of the sliding window
滑动窗口的大小
值----------Value----------
A dataSet object with attributes Cy3, Cy5, Id, Z-score.
Cy3标记属性,Cy5标记,标识的一个DataSet对象,Z-score模型。
举例----------Examples----------
data(Simon)
# Background Correction[背景校正]
c.spot <- bg.correct(Simon)
#Normalized data[规范化的数据]
n.spot <- grid.norm(c.spot,23,24)
#Filter spot[过滤器现货]
f.spot <- filter.spot(n.spot)
#Replicate filtering[复制过滤]
u.spot <- spotUnique(f.spot)
#Zscore analysis[zscore分析]
s.spot <- Zscore(u.spot)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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