genMerge(genArise)
genMerge()所属R语言包:genArise
genMerge: Post-Genomic Analysis
genMerge:后基因组分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
After we finished our slice analysis we get a up-regulated and down-regulated set. This will be the set of study genes for genMege. Given this set, genMerge retrieves functional genomic data for each gene and provides statistical rank scores for over-representation of particular functions in the dataset.
我们完成我们的切片分析后,我们得到了一套上调和下调。这将是研究的基因组genMege。鉴于这一套,genMerge检索每一个基因的功能基因组数据和统计排名分数为代表DataSet中的特定功能。
用法----------Usage----------
genMerge(gene.association, description, population.genes,
study.genes, output.file = "GenMerge.txt")
参数----------Arguments----------
参数:gene.association
The gene-association file links gene names with a particular datum of information using a shorthand of gene-association IDS
基因关联文件与特定的信息,使用速记的基因关联的IDS的基准基因名称
参数:description
The description file contains human-readable description of gene-association IDS
描述文件中包含人类可读的描述的基因关联的IDS
参数:population.genes
Set of all genes detected on a array
设置阵列上检测到的所有基因
参数:study.genes
Set of genes may be those that are up-regulated or down-regulated or both of them.
设置的基因可能上调或下调,或者他们的。
参数:output.file
The name of output file that includes all results obtained after this analisys.
输出文件的名称包括本analisys后获得的所有结果。
注意----------Note----------
This function is completly based on GeneMerge from Cristian
此功能完全地的基础上,从克里斯蒂安GeneMerge
参考文献----------References----------
Department of Statistics Harvard University http://www.oeb.harvard.edu/hartl/lab/publications/GeneMerge
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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