R语言 flowWorkspace包 getGate()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getGate(flowWorkspace)
getGate()所属R语言包：flowWorkspace

                                         Return the flowCore gate definition associated with a node in a GatingHierarchy.
                                         返回的flowCore的门定义了节点在GatingHierarchy。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Return the flowCore gate definition object associated with a node in a GatingHierarchy object.
GatingHierarchy对象中的一个节点，返回flowCore门定义对象。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'GatingHierarchy,character'
getGate(obj, y)
## S4 method for signature 'GatingHierarchy,numeric'
getGate(obj, y,tsort=FALSE)
## S4 method for signature 'GatingSet,numeric'
getGate(obj, y,tsort=FALSE)




参数----------Arguments----------

参数：obj
A GatingHierrarchy or GatingSet  
一个GatingHierrarchy或GatingSet


参数：y
A character when obj is a GatingHierarchy: the name of the node of interest.  Or, a numeric when obj is either a GatingHierarchy or GatingSet. An index into the node list of nodes in the GatingHierarchy or GatingSet.  
一个character时obj是一个GatingHierarchy：感兴趣的节点的名称。或numeric当obj一个GatingHierarchy或GatingSet的。到节点GatingHierarchy或GatingSet的节点列表的索引。


参数：tsort
TRUE|FALSE if true, return the index y will access the nodes in topological sort order.  
TRUE|FALSE如果属实，返回指数y将在拓扑排序顺序访问节点。


值----------Value----------

A gate object from flowCore. Usually a polygonGate, but may be a rectangleGate. Boolean gates are represented by a "BooleanGate" S3 class. This is a list boolean gate definition that references populations in the GatingHierarchy and how they are to be combined logically. If obj is a GatingSet, assuming the trees associated with each GatingHierarchy are identical, then this method will return a list of gates, one for each sample in the GatingSet corresponding to the same population indexed by y.
从flowCore门的对象。通常是polygonGate，但可能是一个rectangleGate。布尔门都代表一个"BooleanGate"S3类。这是列表在GatingHierarchy和如何引用人群，他们将结合逻辑布尔门的定义。如果obj是的GatingSet，假设与树木的每个GatingHierarchy是相同的，那么此方法将返回一个列表门，每个样品的GatingSet相应y索引相同人口。


注意----------Note----------

You should not have to deal with boolean gates. It is sufficient to retrieve the contents of a boolean gate node with getData.
你不应该有处理布尔盖茨。这是足够的检索与getData一个布尔门节点的内容。


作者（S）----------Author(s)----------



Greg Finak <a href="mailto:gfinak@fhcrc.org">gfinak@fhcrc.org</a>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

getData getNodes
getDatagetNodes


举例----------Examples----------


## Not run:         #G is a GatingHierarchy[＃无法运行：＃G是1 GatingHierarchy]
        getGate(G,5,tsort=TRUE) #return the gate for the fifth node in the tree.[返回树中的第五个节点的大门。]
        getGate(G,getNodes(G,tsort=TRUE)[5]) #return the gate for the fifth node in the tree, but fetch it by name.[返回树中的第五个节点的门，但它的名字取。]
        #G is a GatingSet[G是1 GatingSet]
        getGate(G,5,tsort=TRUE) #return a list of gates for the fifth node in each tree, assuming topological sort ordering.[返回的大门在每棵树的第五个节点列表，假设拓扑排序顺序。]


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