R语言 flowPlots包 makeTernaryData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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makeTernaryData(flowPlots)
makeTernaryData()所属R语言包：flowPlots

                                        Prepare PFD Data for a Call to ternaryplot()
                                         PFD的数据准备以ternaryplot检测：（）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a dataframe of polyfunctional degree (pfd) data and  prepares a matrix with 3 columns (egs. PFD1,PFD2,PFD3, or PFD1-2, PFD3-4, PFD5-6)  to use as input to ternaryplot() in the vcd pkg.  If multiple columns are specified for one of the three columns, the percentages for the multiple columns will be summed.  
这个函数接受一个官能度（PFD）的数据的dataframe，并准备用3列（PFD1分别egs.，PFD2，PFD3，或PFD1分别-2，PFD3-4，PFD5-6）矩阵作为输入使用ternaryplot（） VCD PKG。如果指定为一体的三列，多列的多列的百分比将总结。


用法----------Usage----------


   makeTernaryData(pfdData, columns1, columns2, columns3,
      columnNames=c("FD=1","FD=2","FD=3"))



参数----------Arguments----------

参数：pfdData
data frame containing data for 1 or more groups
数据框包含1个或多个组的数据


参数：columns1
numeric; column(s) of pfd data to place in the first column of the matrix
PFD的数据列（S）将在第一列的矩阵数字;


参数：columns2
numeric; column(s) of pfd data to place in the second column of the matrix
PFD的数据列（S）将在第二列的矩阵数字;


参数：columns3
numeric; column(s) of pfd data to place in the third column of the matrix
PFD的数据列（S）将在第三列的矩阵数字;


参数：columnNames
(optional) character vector of names for the three columns of the matrix
（可选）的名称为三列的矩阵的特征向量


值----------Value----------

matrix of 3 columns; rows = subjects, cols = data for each point on the triangle
3列的矩阵;行=科目，COLS =三角形上的每个点的数据


作者（S）----------Author(s)----------


N. Hawkins, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA



参见----------See Also----------

StackedData
StackedData


举例----------Examples----------


## Load the PFD Data to plot in a ternary plot[＃装入PFD数据三元图图]

data(pfdDF)
pfdDataSubset = subset(pfdDF, stim=="LPS" & concGroup==3 & cell=="mDC")

## Prepare the PFD Data for a call to ternaryplot()[＃准备呼叫的PFD数据到ternaryplot（）]

ternaryData = makeTernaryData(pfdDataSubset, 1, 2, 3:4)
colnames(ternaryData) = c("FD1", "FD2", "FD3-4")

## Make the ternary plot[＃三元图]

library(vcd)
ternaryplot(ternaryData, cex=.5, col=as.numeric(pfdDataSubset$group)*2, main="Stimulation = LPS,
   Concentration Group = 3, Cell = mDC")

## Prepare a legend with group stats[＃准备组统计传奇]

adultPFDData = subset(pfdDataSubset, group=="adult", select=c(PFD1FD3))
neoPFDData = subset(pfdDataSubset, group=="neonate", select=c(PFD1FD3))
groupPFDDataList = list(adultPFDData, neoPFDData)
pfdGroupStatsList = computePFDGroupStatsList(groupPFDDataList, pfdValues=1:3, numDigitsMean=3,
   numDigitsSD=2)
groupNames = c("Adults","Neonates")
legendNames = legendPFDStatsGroupNames(pfdGroupStatsList,groupNames)
grid_legend(0.8, 0.7, pch=c(20,20), col=c(2,4), legendNames, title = "Group (n), mean/sd:",
   gp=gpar(cex=.8))

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