plotCytogram(flowPhyto)
plotCytogram()所属R语言包:flowPhyto
Plot a Phytoplankton Cytogram
绘制浮游植物Cytogram
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot a Phytoplankton Cytogram
绘制浮游植物Cytogram
用法----------Usage----------
plotCytogram(df, x.ax, y.ax, add.legend=FALSE, pop.def=POP.DEF, cex=0.5, pch=1, xlab = x.ax, ylab = y.ax, ...)
参数----------Arguments----------
参数:df
a dataframe of events (rows) and channels (columns).
dataframe的事件(行)和渠道(列)。
参数:x.ax
column to plot in the x.axis
列绘制在x.axis
参数:y.ax
column to plot in the y.axis
列绘制在y.axis
参数:add.legend
should the plot automatically generate a legend
图应该自动生成图例
参数:pop.def
A population (rows) definition dataframe with parameters (columns) for gating and clustersing.
一个人口(行)定义dataframe为门和clustersing参数(列)。
参数:cex
character expansion for the points. Undefined background points are 1/3rd of the foreground points.
字符扩展点。 1/3rd的前景不确定的背景点。
参数:pch
point character
点字符
参数:xlab
label for the x axis. by default equals x.ax
为x轴的标签。默认情况下,等于x.ax
参数:ylab
label for the y axis. by default equals y.ax
为y轴的标签。默认情况下,等于y.ax
参数:...
other paramters passed to plot
通过绘制的其他参数研究
值----------Value----------
a cytogram plot
1 cytogram图
举例----------Examples----------
opp.file.path <- system.file("extdata","seaflow_cruise","2011_001", "1.evt.opp",
package="flowPhyto")
pop.file.path <- system.file("extdata","seaflow_cruise","pop.def.tab",
package="flowPhyto")
opp <- readSeaflow(opp.file.path)
def <- readPopDef(pop.file.path)
pop <- classify(x=opp, pop.def= def)
# Visualize the result of Classify using the function plotCytogram()[可视化的分类使用功能plotCytogram(结果)]
plotCytogram(pop, "fsc_small","chl_small", pop.def= def)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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