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R语言 flowCore包 normalization-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 17:45:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
normalization-class(flowCore)
normalization-class()所属R语言包:flowCore

                                        Class "normalization"
                                         类“标准化”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Class and methods to normalize a a flowSet using a potentially complex normalization function.
标准化AA类和方法flowSet使用一个潜在的复杂的标准化功能。


用法----------Usage----------



normalization(parameters, normalizationId="defaultNormalization",
normFunction, arguments=list())

normalize(data, x)




参数----------Arguments----------

参数:parameters
Character vector of parameter names.  
特征向量参数名称。


参数:normalizationId
The identifier for the normalization object.  
为的标准化对象的标识符。


参数:x
An object of class flowSet.  
对象类flowSet。


参数:normFunction
The normalization function
标准化的功能


参数:arguments
The list of additional arguments to normFunction
额外的参数列表normFunction


参数:data
The flowSet to normalize.  
flowSet标准化。


Details

详情----------Details----------

Data normalization of a flowSet is a rather fuzzy concept and the class mainly exists for method dispatch in the workflow tools. The idea is to have a rather general function that takes a flowSet and a list of parameter names as input and applies any kind of normalization to the respective data columns. The output of the function has to be a flowSet again. Although we don't formally check for it, the dimensions of the input and of the output set should remain the same. Additional arguments may be passed to the normalization function via the arguments list. Internally we evaluate the function using do.call and one should check its documentation for details.
数据标准化的一个flowSet是一个相当模糊的概念和方法派遣工作流程中的工具类,主要存在的。这个想法是有一个相当普遍的功能,,flowSet和作为输入的参数名称列表,并适用于任何一种标准化,以各自的数据列。函数的输出是一个flowSet再次。虽然我们没有正式检查它的输入和输出集的尺寸应保持不变。额外的参数,可以传递通过arguments名单标准化的功能。我们内部评估的功能,使用do.call,应检查其细节的文件。

Currently, the most prominent example for a normalization function is warping, as provided by the flowStats package.
目前,标准化功能最突出的例子是翘曲,flowStats包提供。


值----------Value----------

A normalization object for the constructor.
一个normalization对象的构造。

A flowSet for the normalize methods.
一个flowSetnormalize方法。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects should be created using the constructor normalization(). See the Usage and Arguments sections for details.
应该创建对象使用构造normalization()。见Usage和Arguments详情路段。


插槽----------Slots----------




parameters: Object of class "character". The flow parameters that are supposed to be normalized by the
parameters类"character"的对象。流量参数,都被认为是由归




normalizationId: Object of class "character". An identifier for the object.
normalizationId类"character"的对象。一个对象的标识符。




normFunction: Object of class "function" The normalization function. It has to take two mandatory arguments: x, the flowSet, and parameters, a character of parameter names that are to be normalized by the function. Additional arguments have to be passed in via
normFunction类"function"的标准化功能的对象。它有两个强制参数:x,flowSet,parameters,一个字符的参数名称的功能标准化。要通过传递额外的参数




arguments: Object of class "list" A names list
arguments类"list"一个名称列表:对象


方法----------Methods----------




add signature(wf = "workFlow", action =
添加的<code>签名(WF =“工作流”,行动=




identifier<- signature(object = "normalization", value
标识符< - 的<code>签名(对象=“标准化”,价值




identifier signature(object = "normalization"): Get
标识符signature(object = "normalization"):




normalize signature(data = "flowSet", x =
标准化的<code>签名(数据=“flowSet”,X =




parameters signature(object = "normalization"): The
参数signature(object = "normalization"):


作者(S)----------Author(s)----------


F. Hahne

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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