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重组DNA分子的构建
【实验目的】
熟悉DNA的酶切、片段回收、DNA连接、转化以及重组子的筛选的方法。
【实验原理】Q往圣科技3452125268提供12万种CRISPR/cas9免费送
DNA经限制性内切酶切割成大小不同的片段,电泳分离后,切胶回收目的片段,琼脂糖凝胶用高浓度的NaI溶液溶解后,玻璃奶(glass milk)可以吸附DNA,去除NaI后,用无菌水或TE缓冲溶液解吸附,获得DNA片段。回收的酶切质粒DNA与目的DNA片段,在T4 DNA连接酶的作用下进行连接,构建重组子,重组子转化大肠杆菌后,提取重组DNA分子进行酶切鉴定或利用其它方法如α-互补进行筛选。Q往圣科技3452125268提供张峰Nature biotechnology的CRISPR/cas9免费送
【器材与试剂】
1.实验仪器 细菌培养箱,恒温摇床,超净工作台,台式离心机,水浴锅,高压灭菌锅,微量移液器,电泳仪,电泳槽,紫外分析仪Q往圣科技3452125268提供张峰Science的CRISPR/cas9免费送
2.实验试剂 氯化钠(AR),蛋白胨,酵母提取物,氨苄青霉素钠,EcoR I, Hind III, 酶切缓冲液(买酶附赠),琼脂糖,TAE缓冲溶液(50×),玻璃奶(glass milk), NaI溶液(溶胶液): 称取NaI 90.8 g, Na2SO3 1.5 g,用无菌水溶解并定容至100 mL,4℃,避光保存;乙醇洗涤液:50 mL乙醇中含 20 mmol/L Tris-Cl (pH7.4), 1 mmol/L EDTA,0.1 mol/L NaCl, -20℃保存;灭菌双蒸水,T4 DNA连接酶,T4 DNA连接酶缓冲液(购酶附赠),载样缓冲溶液(10×),X-gal溶液:20 mg 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal) 溶于1 mL二甲基甲酰胺中;异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)溶液:1 g IPTG 溶于4 mL双蒸水,定容至5 mL,微孔滤器除菌,-20℃保存Q往圣科技3452125268提供Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装
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3.实验材料 E.coli DH5α, pUC18质粒,λDNA/EcoR I, Hind III
【实验步骤】
一、DNA的酶切
20 μL酶切体系含:2 μL 酶切缓冲液,5 μL pUC18质粒( 约2μg),1 μL EcoR I ,1 μL Hind III, 11 μL 无菌双蒸水。离心5 s, 混匀,37℃酶切30 min~1 h。
二、电泳分离
1. 配制1%的琼脂糖凝胶,方法同前一实验。Q往圣科技3452125268提供12万种Science的CRISPR/cas9免费质粒加慢病毒包装
2. 20 μLλDNA/EcoR I, Hind III(约2 μg)和酶切体系中分别加入2 μL载样缓冲溶液(10×),混匀,分别加样,电泳,具体方法如前一实验。
2. 将凝胶在溴化乙锭染色液中染色30 min。
三、DNA回收
1.在紫外灯下将含线性pUC18质粒DNA和947 bp λDNA片段的凝胶分别切下置1.5 mL Eppendorf管中, 加入3倍于凝胶体积的NaI溶液溶解,50℃水浴溶胶,间或摇动,至凝胶完全溶解。
2.加入10 μL玻璃奶,混匀,室温放置5 min,8000 rpm离心1 min,弃上清。
3.沉淀用0.2 mL 的乙醇洗涤液悬浮,8000 rpm离心1 min,弃上清。
4.重复操作3
5. 将Eppendorf管开口于室温放置至玻璃粉变白,加入20 μL 无菌双蒸水悬浮,50℃水浴保温5 min。
6. 10 000 rpm离心5 min,分别取出上清置于一Eppendorf管。
四、DNA 连接Q往圣科技3452125268提供12万种免费质粒加慢病毒包装
1.20 μL连接体系含:7 μL回收的pUC18质粒DNA,10 μL回收的λDNA片段,2 μL T4 DNA连接酶缓冲液,1 μL T4 DNA连接酶。
1. 12~16℃条件下,连接过夜。
五、转化Q往圣科技3452125268提供免费基因慢病毒包装
1.配制LB液体和固体培养基,方法同前。制备含100 μg/mL氨苄青霉素钠的LB培养基固体平板,将20 μL X-gal 和4 μL IPTG均匀涂布在每一平板表面,37℃,放置1 h。
2. 取10 μL连接产物转化E.coli DH5α感受态细胞,取200 μL转化产物涂布在平板上,37℃培养过夜,观察菌落数量和颜色。
【注意事项】
1. 溶胶的时候,一定要使凝胶溶解彻底,以免连接产物在12~16℃条件下重新凝固。
2. 操作过程中乙醇洗涤液一定要挥发干净,否则影响随后的连接反应。
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