addChromaTOFPeaks(flagme)
addChromaTOFPeaks()所属R语言包:flagme
Add ChromaTOF peak detection results
添加ChromaTOF峰值检测结果
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Reads ASCII tab-delimited format files (output from ChromaTOF) and attaches them to an already created peaksDataset object
读取ASCII制表符分隔的格式的文件(输出从ChromaTOF),并将它们附加到已创建peaksDataset对象
用法----------Usage----------
addChromaTOFPeaks(object,fns=dir(,"[Tt][Xx][Tx]"),rtDivide=60,verbose=TRUE,...)
参数----------Arguments----------
参数:object
a peaksDataset object.
peaksDataset对象。
参数:fns
character vector of same length as object@rawdata (user ensures the order matches)
特征向量的长度相同object@rawdata(用户保证的顺序匹配)
参数:rtDivide
number giving the amount to divide the retention times by.
数量给予的金额划分的保留时间。
参数:verbose
whether to give verbose output, default TRUE
是否给予详细的输出,默认TRUE
参数:...
arguments passed on to parseChromaTOF
参数传递parseChromaTOF
Details
详情----------Details----------
Repeated calls to parseChromaTOF to add peak detection results to the original peaksDataset object.
千呼万唤parseChromaTOF原来peaksDataset对象添加峰值检测结果。
值----------Value----------
peaksDataset object
peaksDataset对象
作者(S)----------Author(s)----------
Mark Robinson
参考文献----------References----------
PhD dissertation University of Melbourne.
参见----------See Also----------
parseChromaTOF, peaksDataset
parseChromaTOF,peaksDataset
举例----------Examples----------
# need access to CDF (raw data) and ChromaTOF files [CDF(原始数据)和ChromaTOF文件需要访问]
require(gcspikelite)
gcmsPath<-paste(.find.package("gcspikelite"),"data",sep="/")
# full paths to file names[文件名的完整路径]
cdfFiles<-dir(gcmsPath,"CDF",full=TRUE)
# [not run] cTofFiles<-dir(gcmsPath,"txt",full=TRUE)[[运行] cTofFiles <目录(gcmsPath,“TXT”,全真)]
# create a 'peaksDataset' object and add ChromaTOF peaks to it[创建一个“peaksDataset”对象和添加ChromaTOF峰]
pd<-peaksDataset(cdfFiles[1],mz=seq(50,550),rtrange=c(7.5,8.5))
# [not run] pd<-addChromTOFPeaks(pd,...)[[不能运行] PD <addChromTOFPeaks(PD,...)]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|