R语言 flagme包 addAMDISPeaks()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

addAMDISPeaks(flagme)
addAMDISPeaks()所属R语言包：flagme

                                        Add AMDIS peak detection results
                                         添加AMDIS的峰值检测结果

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads ASCII ELU-format files (output from AMDIS) and attaches them to an already created peaksDataset object
读取的ASCII ELU的格式文件（AMDIS的输出）和重视他们已经创造了peaksDataset对象


用法----------Usage----------


addAMDISPeaks(object,fns=dir(,"[Eu][Ll][Uu]"),verbose=TRUE,...)



参数----------Arguments----------

参数：object
a peaksDataset object.
peaksDataset对象。


参数：fns
character vector of same length as object@rawdata (user ensures the order matches)
特征向量的长度相同object@rawdata（用户保证的顺序匹配）


参数：verbose
whether to give verbose output, default TRUE
是否给予详细的输出，默认TRUE


参数：...
arguments passed on to parseELU
参数传递parseELU


Details

详情----------Details----------

Repeated calls to parseELU to add peak detection results to the original peaksDataset object.
千呼万唤parseELU原来peaksDataset对象添加峰值检测结果。


值----------Value----------

peaksDataset object
peaksDataset对象


作者（S）----------Author(s)----------


Mark Robinson



参考文献----------References----------

PhD dissertation University of Melbourne.

参见----------See Also----------

parseELU, peaksDataset
parseELU，peaksDataset


举例----------Examples----------


# need access to CDF (raw data) and ELU files [CDF（原始数据）和ELU的文件需要访问]
require(gcspikelite)
gcmsPath<-paste(.find.package("gcspikelite"),"data",sep="/")

# full paths to file names[文件名的完整路径]
cdfFiles<-dir(gcmsPath,"CDF",full=TRUE)
eluFiles<-dir(gcmsPath,"ELU",full=TRUE)

# create a 'peaksDataset' object and add AMDIS peaks to it[创建一个“peaksDataset”对象，并添加AMDIS的山峰]
pd<-peaksDataset(cdfFiles[1],mz=seq(50,550),rtrange=c(7.5,8.5))
pd<-addAMDISPeaks(pd,eluFiles[1])

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