plot-methods(farms)
plot-methods()所属R语言包:farms
Visualizes the distribution of informative and non-informatives genes
可视化的翔实和非informatives的基因分布
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function visualizes the distribution of informative and non-informative genes of a given instance of INI_Calls-class.
此功能可视化信息和非信息的基因,一个给定的实例INI_Calls-class分布。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'INI_Calls,missing'
plot(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
An instance of INI_Calls-class.
INI_Calls-class实例。
值----------Value----------
exprSet-class
exprSet-class
方法----------Methods----------
signature(x = "INI_Calls", y = "missing") An instance of INI_Calls-class.
signature(x = "INI_Calls", y = "missing")INI_Calls-class的实例。
参见----------See Also----------
expFarms, qFarms,lFarms,INIcalls,summary
expFarms,qFarms,lFarms,INIcalls,summary
举例----------Examples----------
data(testAffyBatch)
eset <- expFarms(testAffyBatch, bgcorrect.method = "rma", pmcorrect.method = "pmonly", normalize.method = "constant")
INIs <- INIcalls(eset) # apply I/NI calls[申请的I /倪通话]
summary(INIs)
plot(INIs) # draws a density plot of I/NI-calls[我/倪调用绘制密度图]
I_data <- getI_Eset(INIs) # affybatch containing only informative probe sets[affybatch包含只有翔实的探针组]
NI_data <- getNI_Eset(INIs) # affybatch containing only non-informative probe sets[affybatch含有唯一的非翔实的探针组]
I_probes <- getI_ProbeSets(INIs) # vector containing only informative probe sets names[向量,只有翔实探针设置名称]
NI_probes <- getNI_ProbeSets(INIs) # vector containing only non-informative probe sets names[向量,只有非翔实的探针设置名称]
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