summarize.miR(ExiMiR)
summarize.miR()所属R语言包:ExiMiR
ExiMiR summarization function.
ExiMiR汇总功能。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Apply median summarization on the given AffyBatch object according to the GAL or CDF environment
应用中位数总结在给定的AffyBatch对象根据GAL或民防部队环境
用法----------Usage----------
summarize.miR(abatch, out.type=c("ExpressionSet","data.frame"))
参数----------Arguments----------
参数:abatch
An AffyBatch Object.
AffyBatch对象。
参数:out.type
Character vector. By default, the output is an ExpressionSet. data.frame can be also used.
特征向量。默认情况下,输出是一个ExpressionSet。 data.frame也可以使用。
Details
详情----------Details----------
The GAL or CDF environment hash is used to gather probes median intensity values into the probeset record.
GAL或CDF环境哈希是用来收集探针到probeset记录的强度值的中位数。
值----------Value----------
An ExpressionSet or a data.frame depending on the out.type argument.
ExpressionSet或data.frame根据的out.type参数。
作者(S)----------Author(s)----------
Sylvain.Gubian, Alain Sewer, PMP SA
举例----------Examples----------
data(galenv)
data(GSE20122)
abatch.spike <- norm.miR(GSE20122, figures.show=FALSE)
eset.spike <- summarize.miR(abatch.spike)
data.spike <- summarize.miR(abatch.spike, out.type="data.frame")
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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