R语言 EDASeq包 plotQuality-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotQuality-methods(EDASeq)
plotQuality-methods()所属R语言包：EDASeq

                                          Methods for Function plotQuality in Package EDASeq
                                         为函数在包装EDASeq plotQuality方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plotQuality produces a plot of the quality of the reads.
plotQuality产生的读取质量的图。


方法----------Methods----------

It produces a plot that summarizes the per-base mean quality of the reads of each BAM file in x.
它产生了一个图，总结了每个BAM的文件读取x每个碱基平均质量。

It produces a boxplot of the per-base distribution of the quality scores of the reads in x.
它产生的读取x质量分数每基分布的盒形图。

It produces a plot that summarizes the per-base mean quality of the reads of each FASTQ file in x.
它产生一个图总结x的读取每个FASTQ文件的每个碱基平均质量。


Details

详情----------Details----------

Since FASTQ files can be very long, it can be very expensive to process a whole file. One way to avoid this, is to consider a subset of the file and then plot the quality of the subset. As long as one assumes that the subset is random, this is a good approximation. The function FastqSampler of ShortRead can be used for this. See its help page for an example.
由于FASTQ文件可以很长，它可以是非常昂贵的处理整个文件。为了避免这个问题的方法之一，是考虑该文件的一个子集，然后绘制子集的质量。只要一个假设的子集是随机的，这是一个很好的近似。功能FastqSamplerShortRead可以用于此。“一个例子，请参阅它的帮助页。

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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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