stackObjects(EBImage)
stackObjects()所属R语言包：EBImage
Places detected objects into an image stack
地方检测到的图像堆栈中的对象
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Places detected objects into an image stack.
地方检测到的图像堆栈中的对象。
用法----------Usage----------
stackObjects(x, ref, index, combine=TRUE, rotate, bg.col='black', ext, centerby, rotateby)
参数----------Arguments----------
参数：x
An Image object or an array containing object masks. Object masks are sets of pixels with the same unique integer value.
Image对象或数组，包含对象口罩。对象口罩套像素具有相同的唯一的整数值。
参数：ref
An Image object or an array, containing the intensity values of the objects.
Image对象或数组，包含对象的强度值。
参数：combine
If x contains multiple images, specifies if the resulting list of image stacks with individual objects should be combined using combine into a single image stack.
x如果包含多个图像，指定应结合使用combine到一个单一的形象栈与个别物体的图像栈。
参数：bg.col
Background pixel color.
背景像素的颜色。
参数：ext
A numeric controlling the size of the output simage. If missing, ext is estimated from data. See details.
数字控制的输出simage的大小。如果丢失，ext估计数据。查看详情。
参数：index, rotate, centerby, rotateby
Deprecated.
已过时。
Details
详情----------Details----------
stackObjects creates a set of nbobj images of size (2*ext+1, 2*ext+1), where nbobj is the number of objects in x, and places each object of x in this set.
stackObjectsnbobj大小的图像（2*ext+12*ext+1），其中nbobj是对象x的数量，并创建一个集地方x在这个集合的每个对象。
If not specified, ext is estimated using the 95% quantile of 2*sqrt(g.l1), where g.l1 is the semi-major axis descriptor extracted from hullFeatures, taken over all the objects of the image x.
如果没有指定，ext估计使用2 * SQRT（g.l1），其中g.l1是半长轴描述，从hullFeatures提取，95％分位数超过图像x所有的对象。
值----------Value----------
An Image object containing the stacked objects contained in x. If x contains multiple images and if combine is TRUE, stackObjects returns a list of Image objects.
一个Image对象，其中包含了堆放在x包含的对象。如果x包含多张图片，如果combineTRUE，stackObjectsImage对象返回一个列表。
作者（S）----------Author(s)----------
Oleg Sklyar, <a href="mailto sklyar@ebi.ac.uk">osklyar@ebi.ac.uk</a>, 2006-2007
参见----------See Also----------
combine, tile, hullFeatures
combine，tile，hullFeatures
举例----------Examples----------
## simple example[＃简单的例子]
x = readImage(system.file('images', 'shapes.png', package='EBImage'))
x = x[110:512,1:130]
y = bwlabel(x)
if (interactive()) display(normalize(y), title='Objects')
z = stackObjects(y, normalize(y))
if (interactive()) display(z, title='Stacked objects')
## load images[＃载入图像]
nuc = readImage(system.file('images', 'nuclei.tif', package='EBImage'))
cel = readImage(system.file('images', 'cells.tif', package='EBImage'))
img = rgbImage(green=cel, blue=nuc)
if (interactive()) display(img, title='Cells')
## segment nuclei[＃段原子核的]
nmask = thresh(nuc, 10, 10, 0.05)
nmask = opening(nmask, makeBrush(5, shape='disc'))
nmask = fillHull(bwlabel(nmask))
## segment cells, using propagate and nuclei as 'seeds'[＃段的单元，利用宣传和核作为“种子”]
ctmask = opening(cel>0.1, makeBrush(5, shape='disc'))
cmask = propagate(cel, nmask, ctmask)
## using paintObjects to highlight objects[＃使用paintObjects的突出对象]
res = paintObjects(cmask, img, col='#ff00ff')[FF00FF）]
res = paintObjects(nmask, res, col='#ffff00')[FFFF00“）]
if (interactive()) display(res, title='Segmented cells')
## stacked cells[＃堆放单元]
st = stackObjects(cmask, img)
if (interactive()) display(st, title='Stacked objects')
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注：
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发表于 2012-2-25 16:56:03
