R语言 EBImage包 paintObjects()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

paintObjects(EBImage)
paintObjects()所属R语言包：EBImage

                                        Marks objects in images
                                         图像中的标记对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function marks objects in images.
此功能标志着图像中的对象。


用法----------Usage----------


  paintObjects(x, tgt, opac=c(1, 1), col=c('red', NA))



参数----------Arguments----------

参数：x
An Image object in Grayscale color mode or an array containing object masks. Object masks are sets of pixels with the same unique integer value.
ImageGrayscale颜色模式或一个数组，包含对象口罩对象。对象口罩套像素具有相同的唯一的整数值。


参数：tgt
An Image object or an array, containing the intensity values of the objects.
Image对象或数组，包含对象的强度值。


参数：opac
A numeric vector of two opacity values for drawing object boundaries and object bodies. Opacity ranges from 0 to 1, with 0 being fully transparent and 1 fully opaque.
一个数字的两个绘制对象边界和对象机构的透明度值的向量。不透明度范围从0到1，0是完全透明和1完全不透明。


参数：col
A character vector of two R colors for drawing object boundaries and object bodies. By default, object boundaries are painted in red while object bodies are not painted.
两个R色彩绘制对象边界和对象机构的一个特征向量。默认情况下，对象边界画在red不画而对象机构。


值----------Value----------

An Image object or an array, containing the painted version of tgt.
一个Image对象或数组，包含tgt的画版。


作者（S）----------Author(s)----------



Oleg Sklyar, <a href="mailtosklyar@ebi.ac.uk">osklyar@ebi.ac.uk</a>, 2006-2007




参见----------See Also----------

bwlabel, watershed, link{getFeatures}
bwlabel，watershed，link{getFeatures}


举例----------Examples----------


  ## load images[＃载入图像]
  nuc = readImage(system.file('images', 'nuclei.tif', package='EBImage'))
  cel = readImage(system.file('images', 'cells.tif', package='EBImage'))
  img = rgbImage(green=cel, blue=nuc)
  if (interactive()) display(img, title='Cells')

  ## segment nuclei[＃段原子核的]
  nmask = thresh(nuc, 10, 10, 0.05)
  nmask = opening(nmask, makeBrush(5, shape='disc'))
  nmask = fillHull(nmask)
  nmask = bwlabel(nmask)
  if (interactive()) display(normalize(nmask), title='Cell nuclei mask')

  ## segment cells, using propagate and nuclei as 'seeds'[＃段的单元，利用宣传和核作为“种子”]
  ctmask = opening(cel>0.1, makeBrush(5, shape='disc'))
  cmask = propagate(cel, nmask, ctmask)
  if (interactive()) display(normalize(cmask), title='Cell mask')

  ## using paintObjects to highlight objects[＃使用paintObjects的突出对象]
  res = paintObjects(cmask, img, col='#ff00ff')[FF00FF）]
  res = paintObjects(nmask, res, col='#ffff00')[FFFF00“）]
  if (interactive()) display(res, title='Segmented cells')

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