subset.CNA(DNAcopy)
subset.CNA()所属R语言包:DNAcopy
Subset a ‘Copy Number Array’ data object
“拷贝数数组的子集数据对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to return a subset of a copy number array data object by a list of chromosomes and sample.
函数返回一个拷贝数的数组数据对象的一个子集,由染色体和样品列表。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'CNA'
subset(x, chromlist=NULL, samplelist=NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
Copy number array data object
拷贝数的数组数据对象
参数:chromlist
chromosomes of interest. Should be a subset of the valid chromosome names in the original data.
染色体的利益。应该在原始数据的有效染色体名的一个子集。
参数:samplelist
samples of interest. Can be integers denoting the samples of interest or a vector of valid sample names.
样品的利益。可以是整数,表示感兴趣的样品或向量有效样本名。
参数:...
other arguments which may be passed to subset.
其他参数可通过subset。
值----------Value----------
An object of class CNA with the data for the list of chromosomes and samples of interest.
一个类的对象CNA和利益的染色体样本名单中的数据。
举例----------Examples----------
data(coriell)
#Combine into one CNA object to prepare for analysis on Chromosomes 1-23[结合成一个中央社的对象,准备进行分析,染色体1-23]
CNA.object <- CNA(cbind(coriell$Coriell.05296,coriell$Coriell.13330),
coriell$Chromosome,coriell$Position,
data.type="logratio",sampleid=c("c05296","c13330"))
#Take the first ten chromosomes of the first sample[采取的第一个样品的前十位的染色体]
#subset.CNA.object <- subset.CNA(CNA.object,chromlist=1:10,samplelist="c05296")[< - subset.CNA subset.CNA.object(CNA.object,chromlist = 1:10,samplelist =“c05296”)]
subset.CNA.object <- subset(CNA.object,chromlist=1:10,samplelist="c05296")
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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