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R语言 DNAcopy包 segments.summary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 16:42:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
segments.summary(DNAcopy)
segments.summary()所属R语言包:DNAcopy

                                        Additional summary measured for the segments
                                         测量分部额外摘要

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This program computes the standard deviation, median and the mad of the data for each segment found by the CBS algorithm.
此方案计算标准差,中位数和各分部的数据由CBS算法发现的疯狂。


用法----------Usage----------


  segments.summary(x)



参数----------Arguments----------

参数:x
an object of class DNAcopy
一个类DNAcopy的对象


值----------Value----------

a data frame with nine columns.  The sd, median and mad of each segment is added to the six columns from the segment command.
与九路纵队的数据框。 SD,中位数和各分部疯狂添加到六个段命令列。


作者(S)----------Author(s)----------


Venkatraman E. Seshan



举例----------Examples----------



# test code on an easy data set[一个简单的数据集上的测试代码]
set.seed(25)
genomdat1 <- rnorm(500, sd=0.1) +
rep(c(-0.2,0.1,1,-0.5,0.2,-0.5,0.1,-0.2),c(137,87,17,49,29,52,87,42))
genomdat2 <- rnorm(500, sd=0.1) +
rep(c(-0.2,0.1,1,-0.5,0.2,-0.5,0.1,-0.2),c(137,87,17,49,29,52,87,42))
genomdat1[sample(1:500,5)] <- NA
chrom <- rep(1:2,c(290,210))
maploc <- c(1:290,1:210)
test1 <- segment(CNA(cbind(genomdat1,genomdat2), chrom, maploc))
segments.summary(test1)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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