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R语言 DEXSeq包 fitDispersionFunction()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 16:34:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
fitDispersionFunction(DEXSeq)
fitDispersionFunction()所属R语言包:DEXSeq

                                        Fit the mean-variance function.
                                         适合的均值 - 方差函数。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function fits a parametric model of the mean-dispersion relationship to the per-gene estimates of mean \hat{μ} and dispersion \hat{α}. The parametric
此功能适合每个基因平均\hat{μ}和分散\hat{α}估计参数模型的平均色散关系。参数化

where μ is the mean, α the dispersion and  α_1 and α_0 are two parameters. After this, for each exon, the maximum between the per-gene estimate \hat{α} and the modelled value \hat{α}_1/\hat{μ} + \hat{α}_0 is stored in fData$dispersion.
其中μ平均α分散和α_1和α_0两个参数。在此之后,每个外显子,每个基因的估计之间的最大\hat{α}和模拟值\hat{α}_1/\hat{μ} + \hat{α}_0被储存在fData$dispersion。


用法----------Usage----------


fitDispersionFunction(ecs)



参数----------Arguments----------

参数:ecs
An ExonCountSet object.  
一个ExonCountSet的对象。


值----------Value----------

An ExonCountSet object with information of the fit included, as well as fData(ecs)$dispersion filled.
一个合适的信息ExonCountSet对象包括,以及fData(ecs)$dispersion填补的。


举例----------Examples----------


        data("pasillaExons", package="pasilla")
        pasillaExons <- estimateSizeFactors( pasillaExons )
        pasillaExons <- estimateDispersions( pasillaExons )
        pasillaExons <- fitDispersionFunction( pasillaExons )

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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