estimateSizeFactors(DEXSeq)
estimateSizeFactors()所属R语言包:DEXSeq
Estimate the size factors for an ExonCountSet
估计一个ExonCountSet的大小因素
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes the count data from an ExonCountSet object (object), and estimates the size factors as follows: Each column (sample) is divided by the geometric means of the rows. The median of these ratios (skipping the genes with a geometric mean of zero) is used as the size factor for this column.
此功能需要从ExonCountSet对象(对象)的计数数据,估计规模的因素如下:每个列(样本)除以行的几何方法。这些比率中位数(跳过为零的几何平均数的基因)被用作此列的大小因素。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'ExonCountSet'
estimateSizeFactors(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
An ExonCountSet object
一个ExonCountSet对象
值----------Value----------
The ExonCountSet passed as parameters, with the size factors filled in.
的ExonCountSet作为参数传递,填平大小因素
作者(S)----------Author(s)----------
Simon Anders, sanders@fs.tum.de
举例----------Examples----------
data("pasillaExons", package="pasilla")
pasillaExons <- estimateSizeFactors( pasillaExons )
sizeFactors( pasillaExons )
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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