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R语言 DEXSeq包 estimateSizeFactors()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 16:34:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
estimateSizeFactors(DEXSeq)
estimateSizeFactors()所属R语言包:DEXSeq

                                         Estimate the size factors for an ExonCountSet
                                         估计一个ExonCountSet的大小因素

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes the count data from an ExonCountSet object (object), and estimates the size factors  as follows: Each column (sample) is divided by the geometric means of the rows. The median of these ratios (skipping the genes with a geometric mean of zero) is used as the size factor for this column.
此功能需要从ExonCountSet对象(对象)的计数数据,估计规模的因素如下:每个列(样本)除以行的几何方法。这些比率中位数(跳过为零的几何平均数的基因)被用作此列的大小因素。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'ExonCountSet'
estimateSizeFactors(object)



参数----------Arguments----------

参数:object
An ExonCountSet object  
一个ExonCountSet对象


值----------Value----------

The ExonCountSet passed as parameters, with the size factors filled in.
的ExonCountSet作为参数传递,填平大小因素


作者(S)----------Author(s)----------



Simon Anders, sanders@fs.tum.de




举例----------Examples----------


        data("pasillaExons", package="pasilla")
        pasillaExons <- estimateSizeFactors( pasillaExons )
        sizeFactors( pasillaExons )

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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