R语言 DEXSeq包 countTableForGene()函数中文帮助文档(中英文对照)

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countTableForGene(DEXSeq)
countTableForGene()所属R语言包：DEXSeq

                                         Count table for a given geneID.
                                         一个给定的geneID算表。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns a matrix of non negative integers containing  a count table for a specified geneID from an ExonCountSet object.   The count table contains one row for every counting bin of the gene and  a column for every sample.
这个函数返回一个非负整数，包含一个指定geneID从ExonCountSet对象计数表的矩阵。伯爵表包含一个行计数为每一个基因的bin和每个样品列。


用法----------Usage----------


countTableForGene(ecs, geneID, normalized=FALSE, withDispersion=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：ecs
An ExonCountSet.  
一个ExonCountSet。


参数：geneID
A geneID to get the count table.  
，一个geneID伯爵表。


参数：normalized
If TRUE, the raw counts will be normalized by the size factors.  
如果为TRUE，将标准化的原始计数的大小因素。


参数：withDispersion
If TRUE, an extra column with the dispersion estimate used in the  test will added to the count table.  
如果为TRUE，在测试中使用的分散估计额外列添加到伯爵表。


参见----------See Also----------

estimateSizeFactors
estimateSizeFactors


举例----------Examples----------


   data("pasillaExons", package="pasilla")
   pasillaExons <- estimateSizeFactors( pasillaExons )
   countTableForGene(pasillaExons, "FBgn0085442", normalized=FALSE)

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注：
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