R语言 DESeq包 estimateSizeFactors()函数中文帮助文档(中英文对照)

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estimateSizeFactors(DESeq)
estimateSizeFactors()所属R语言包：DESeq

                                         Estimate the size factors for a CountDataSet
                                         估计一个CountDataSet的大小因素

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Estimate the size factors for a CountDataSet
估计一个CountDataSet的大小因素


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CountDataSet'
estimateSizeFactors( object, locfunc=median, ... )



参数----------Arguments----------

参数：object
a CountDataSet  
1 CountDataSet


参数：locfunc
a function to compute a location for a sample. By default, the median is used. However, especially for low counts, the shorth may give better results.     
一个函数来计算样品的位置。默认情况下，中位数。然而，尤其是低计数，shorth可能得到更好的结果。


参数：...
extra arguments are ignored
额外的参数将被忽略


Details

详情----------Details----------

You need to call this function right after newCountDataSet unless you have manually specified size factors.
之后，你需要调用此功能newCountDataSet除非你已经手动指定大小的因素。

Typically, the function is called with the idiom
通常情况下，函数被调用的成语

cds <- estimateSizeFactors( cds )
cds <- estimateSizeFactors( cds )

This estimates the size factors and stores the information in the object.
这估计规模因素和存储对象的信息。

Internally, the function calls estimateSizeFactorsForMatrix. See there for more details on the calculation.
内部的函数调用estimateSizeFactorsForMatrix。看到有计算的更多细节。


值----------Value----------

The CountDataSet passed as parameters, with the size factors filled in.
的CountDataSet作为参数传递，填平大小因素


作者（S）----------Author(s)----------



Simon Anders, sanders@fs.tum.de




参见----------See Also----------

estimateSizeFactorsForMatrix
estimateSizeFactorsForMatrix


举例----------Examples----------


cds <- makeExampleCountDataSet()
cds <- estimateSizeFactors( cds )
sizeFactors( cds )

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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